235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6308 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  73.23 
 
 		 507 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  71.82 
 
 		 508 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  100 
 
 		 507 aa  1013    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  98.03 
 
 		 507 aa  995    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  73.62 
 
 		 507 aa  736    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  98.03 
 
 		 507 aa  995    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  63.1 
 
 		 511 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  55.05 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  56.84 
 
 		 533 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  56.27 
 
 		 508 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  53.71 
 
 		 523 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  55.47 
 
 		 508 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  55.38 
 
 		 515 aa  545  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  53.75 
 
 		 523 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  56.69 
 
 		 538 aa  542  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  54.9 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  53.16 
 
 		 523 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  54.6 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  53.07 
 
 		 509 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  57.26 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  55.1 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  53.15 
 
 		 509 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  54.46 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  55.49 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  52.64 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  52.95 
 
 		 510 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  53.95 
 
 		 514 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  54.4 
 
 		 508 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  54.24 
 
 		 513 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  54.01 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  52.66 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  55.25 
 
 		 508 aa  519  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  53.16 
 
 		 519 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  53.56 
 
 		 514 aa  519  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  52.57 
 
 		 508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  55.91 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  52.64 
 
 		 509 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  52.64 
 
 		 507 aa  512  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  54.37 
 
 		 509 aa  512  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  53.61 
 
 		 501 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  52.37 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  52.25 
 
 		 507 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  52.63 
 
 		 507 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  52.17 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  52.65 
 
 		 500 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  49.8 
 
 		 515 aa  501  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  50.88 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  52.01 
 
 		 525 aa  498  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  50.5 
 
 		 509 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  51.98 
 
 		 510 aa  491  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  50.4 
 
 		 510 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  51.96 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  52.73 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  51.76 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  47.72 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  49.22 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  49.34 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  41.75 
 
 		 514 aa  342  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  37.01 
 
 		 505 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4684  galactarate dehydratase  42.08 
 
 		 516 aa  329  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.360454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  41.88 
 
 		 498 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  42.47 
 
 		 503 aa  324  2e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  39.64 
 
 		 533 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  38.24 
 
 		 512 aa  322  8e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  40.12 
 
 		 518 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  41.53 
 
 		 530 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0840  galactarate dehydratase  37.9 
 
 		 524 aa  316  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  40.57 
 
 		 517 aa  315  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  41.12 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  37.75 
 
 		 524 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  37.8 
 
 		 533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  37.8 
 
 		 533 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  40.98 
 
 		 507 aa  312  9e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3398  galactarate dehydratase  37.15 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4547  D-galactarate dehydratase  39.43 
 
 		 517 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3104  galactarate dehydratase  37.98 
 
 		 548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  36.35 
 
 		 524 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0190  D-galactarate dehydratase  38.76 
 
 		 564 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4225  galactarate dehydratase  39.21 
 
 		 517 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0830  galactarate dehydratase  39.07 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  35.45 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  37.82 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  41.88 
 
 		 390 aa  302  8.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2315  galactarate dehydratase  38.51 
 
 		 517 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  38.43 
 
 		 513 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  39.76 
 
 		 534 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3690  galactarate dehydratase  37.45 
 
 		 524 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  37.15 
 
 		 532 aa  301  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3100  galactarate dehydratase  37.63 
 
 		 517 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2816  galactarate dehydratase  39.07 
 
 		 517 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0628742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4865  galactarate dehydratase  35.99 
 
 		 529 aa  299  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0784645  normal  0.0391217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2595  galactarate dehydratase  38.82 
 
 		 518 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.865762  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3601  D-galactarate dehydratase, putative  37.86 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.271934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  37.85 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  35.48 
 
 		 550 aa  297  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  37.17 
 
 		 496 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  34.69 
 
 		 496 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4734  galactarate dehydratase  36.45 
 
 		 530 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481286  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5203  galactarate dehydratase  37.9 
 
 		 517 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3409  galactarate dehydratase  37.72 
 
 		 518 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219407  normal  0.594385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>