178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6106 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6106  putative transmembrane sensor  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  34.69 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  29.37 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  31.78 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.01 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  28.16 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  30.42 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  27.45 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  32.2 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  31.02 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  29.35 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  28.44 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  29.21 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  28.62 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.83 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  30.23 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.63 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.46 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  27.57 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  27.91 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.9 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  28.15 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  27.53 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1827  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  0.321003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  27.24 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.71 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  29.66 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4300  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  26.58 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.060712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  26 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  28.67 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  26.58 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  30.14 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  27.3 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  26.97 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  28.84 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  27.67 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  26.03 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  26.58 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  26.23 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  26.75 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4645  anti-FecI sigma factor, FecR  29.25 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  26.42 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  30.74 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  27.19 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  27.16 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  26.85 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  32.92 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1285  Fe2+-dicitrate sensor membrane component-like protein  26.89 
 
 		 327 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.914748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  25.84 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  25.88 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  28.67 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  27.24 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  25.9 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  29.08 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  26.89 
 
 		 318 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  27.48 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  29.6 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  28 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3316  anti-FecI sigma factor, FecR  26.12 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  28.83 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  27.33 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  25.96 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  25.48 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  29.93 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  28.82 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  30.21 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  25.63 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  27.45 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  27.74 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.07 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  28.01 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  26.38 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  30.4 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  26.52 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  25.57 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  26.71 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  24.6 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  28.86 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.15 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  29.39 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  25.82 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  23.83 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  28.48 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  28.04 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  26.01 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  25.49 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  25.75 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  28.01 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  25.74 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  26.37 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  28.67 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  30.5 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  28.35 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  22.8 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  28.61 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>