99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1455 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6373  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1455  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.851928  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6913  transcriptional regulator TrmB  93.7 
 
 		 272 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1711  transcriptional regulator TrmB  75.28 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1597  transcriptional regulator, TrmB  30.51 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1849  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1771  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1721  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.945623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1550  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1561  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1598  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1794  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3603  hypothetical protein  29.66 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4091  hypothetical protein  28.52 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1740  hypothetical protein  29.24 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2039  helix-turn-helix family DUF118  33.73 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0136  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.516292  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06640  transcriptional regulator, TrmB  27.35 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.22042e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0464  transcriptional regulator, TrmB  30.74 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.872456  unclonable  0.00001282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0895  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  hitchhiker  0.000000338741 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3605  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.997022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4842  transcriptional regulator, TrmB  25.54 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1029  hypothetical protein  23.43 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4924  transcriptional regulator, TrmB  33.55 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3606  transcriptional regulator, TrmB  27.16 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0833  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0984  hypothetical protein  27.44 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4328  hypothetical protein  27.44 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.442126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1112  hypothetical protein  23.01 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.194867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1025  hypothetical protein  26.83 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3376700000000002e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0841  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0087  hypothetical protein  25.97 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0853  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.829949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0885  hypothetical protein  26.22 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.674449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5157  hypothetical protein  25.54 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0938  hypothetical protein  26.38 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4740  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5164  hypothetical protein  27.16 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5257  hypothetical protein  26.41 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4725  transcriptional regulator  26.41 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4883  hypothetical protein  26.41 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5125  hypothetical protein  26.41 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5152  hypothetical protein  26.41 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1951  transcriptional regulator, TrmB  30.91 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4896  transcriptional regulator, TrmB  33.13 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1985  transcriptional regulator, TrmB  31.91 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.583082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0114  transcriptional regulator TrmB  29.1 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000433337 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1202  transcriptional regulator, TrmB  29.14 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3875  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.936215  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0750  transcriptional regulator, TrmB  32.65 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0487  transcriptional regulator, TrmB  34.62 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.194536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0191  transcriptional regulator, TrmB  28.75 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1154  transcriptional regulator, TrmB  25.2 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00116341  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1683  transcriptional regulator, TrmB  32.84 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2535  transcriptional regulator, TrmB  25.16 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2665  hypothetical protein  26.75 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3331  hypothetical protein  36.08 
 
 		 119 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0582813  normal  0.0569842 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1091  transcriptional regulator TrmB  34.67 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1897  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0861  transcriptional regulator, TrmB  27.94 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1982  transcriptional regulator, TrmB  20.65 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1535  transcriptional regulator, TrmB  25.17 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1270  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1856  transcriptional regulator, TrmB  23.88 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0497  hypothetical protein  27.61 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4615  transcriptional regulator, TrmB  28.26 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0680  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1011  transcriptional regulator, TrmB  39.76 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.609818 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2791  transcriptional regulator, TrmB  32.98 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2487  transcriptional regulator, TrmB  27.69 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.555087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2864  transcriptional regulator, TrmB  29.34 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1209  transcriptional regulator, TrmB  31.62 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1445  transcriptional regulator, TrmB  29.85 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1399  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.913675  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2683  transcriptional regulator, TrmB  42.03 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.808403 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0826  hypothetical protein  31.52 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0459  transcriptional regulator, TrmB  28.71 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.160981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3250  transcriptional regulator, TrmB  23.11 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0272  transcriptional regulator, TrmB  26.19 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.369583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2312  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1591  transcriptional regulator, TrmB  33.98 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.230504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2614  transcriptional regulator, TrmB  29.11 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.768111 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2203  transcriptional regulator, TrmB  32.47 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2275  transcriptional regulator, TrmB  32.71 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.509638  normal  0.232482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2854  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.627477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0014  transcriptional regulator, TrmB  23.19 
 
 		 354 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.336758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1532  transcriptional regulator, TrmB  29.87 
 
 		 350 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2263  transcriptional regulator, TrmB  23.68 
 
 		 358 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0490  transcriptional regulator, TrmB  32.05 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1562  transcriptional regulator, TrmB  32.18 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1347  transcriptional regulator, TrmB  26.04 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2745  transcriptional regulator, TrmB  36.99 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0988  RNA polymerase Rbp10  28.28 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.883487  normal  0.725953 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2233  transcriptional regulator, TrmB  28.41 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000408105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3670  hypothetical protein  24.77 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.697327  normal  0.0551294 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0689  transcriptional regulator, TrmB  29.79 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4098  transcriptional regulator, TrmB  24.28 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2552  transcriptional regulator, TrmB  26.98 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3578  hypothetical protein  29.23 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0712382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>