More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2208 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 		 220 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  84.73 
 
 		 227 aa  334  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  87.7 
 
 		 226 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  84.21 
 
 		 229 aa  323  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  84.66 
 
 		 220 aa  317  9e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  71.23 
 
 		 215 aa  301  6.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  72.56 
 
 		 229 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  72.2 
 
 		 201 aa  296  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  72.55 
 
 		 201 aa  295  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  72.58 
 
 		 207 aa  278  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  70.43 
 
 		 212 aa  271  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  70.81 
 
 		 197 aa  271  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  71.12 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  73.37 
 
 		 214 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.08 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  65.08 
 
 		 206 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.46 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  69.02 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  71.28 
 
 		 198 aa  258  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.38 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.31 
 
 		 199 aa  254  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.45 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.89 
 
 		 194 aa  251  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  66.3 
 
 		 213 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  63.92 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  65.78 
 
 		 205 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.26 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  66.12 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.22 
 
 		 210 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.22 
 
 		 210 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  61.34 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  70.49 
 
 		 207 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  57.29 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.86 
 
 		 205 aa  242  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  63.3 
 
 		 189 aa  240  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  60.42 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.85 
 
 		 197 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.95 
 
 		 194 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.95 
 
 		 191 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  56.59 
 
 		 195 aa  208  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.95 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  45.02 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  48.56 
 
 		 261 aa  189  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.48 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  45.9 
 
 		 191 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.68 
 
 		 194 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.15 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.45 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.17 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.13 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.36 
 
 		 188 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.67 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.05 
 
 		 194 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.89 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.39 
 
 		 205 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.02 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  42.08 
 
 		 187 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.92 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.13 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.76 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.95 
 
 		 242 aa  148  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.44 
 
 		 198 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  37.17 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.07 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.81 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.84 
 
 		 198 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.54 
 
 		 243 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.97 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.98 
 
 		 190 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  39.85 
 
 		 159 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.05 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.07 
 
 		 704 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 636 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  35.19 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  39.34 
 
 		 461 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.45 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 352 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 122 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  41.53 
 
 		 120 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 359 aa  96.7  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.66 
 
 		 701 aa  95.1  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 		 257 aa  95.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  37.5 
 
 		 429 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.34 
 
 		 455 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 989 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 450 aa  91.7  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 117 aa  91.3  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 		 336 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 122 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.5 
 
 		 455 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 120 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  37.98 
 
 		 131 aa  90.1  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.31 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 122 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  40 
 
 		 120 aa  90.1  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>