More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0578 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 407 aa  800    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0582  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  31.49 
 
 		 415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  31.49 
 
 		 415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  31.49 
 
 		 415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  31.49 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.71 
 
 		 448 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  25.84 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  27.49 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  25.45 
 
 		 450 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  25.74 
 
 		 450 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  29.53 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  25.33 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  24.32 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  25.17 
 
 		 451 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  26.49 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  26.79 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  26.15 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  24.7 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  24.7 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  24.7 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  24.7 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  24.7 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  24.7 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  26.94 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  26.84 
 
 		 450 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  24.7 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  27.98 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  25.99 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  24.76 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  25.53 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  25.12 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  23.83 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  23.83 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  26.6 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  23.83 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  23.83 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  24.46 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  25.99 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  26.64 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  23.83 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  25.62 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  25.23 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  25.23 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8106  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 502 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  26.71 
 
 		 485 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 418 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  26.49 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  25.12 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 426 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  25.84 
 
 		 445 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  25.12 
 
 		 454 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  27.18 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  25.43 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  25.65 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  26.61 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  26.61 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  26.61 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 456 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  26.61 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  26.61 
 
 		 444 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>