More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6364 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  93.89 
 
 		 395 aa  759    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  93.89 
 
 		 395 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  84.65 
 
 		 396 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  98.48 
 
 		 395 aa  800    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  93.89 
 
 		 395 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  100 
 
 		 395 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  53.05 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  52.42 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  51.17 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  51.28 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  52.12 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  50.91 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  48.99 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  50.77 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  49.49 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  50.64 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  49.49 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  48.59 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  54.88 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  49.11 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  49.2 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  48.74 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  50.39 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  48.23 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  47.98 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  48.46 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  47.98 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  50.27 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  49.1 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.04 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  49.1 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  49.1 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  49.1 
 
 		 396 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  49.08 
 
 		 397 aa  362  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  48.59 
 
 		 399 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  49.09 
 
 		 402 aa  358  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  50.27 
 
 		 396 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  50 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  46.79 
 
 		 397 aa  356  5e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  50 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  49.73 
 
 		 396 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  47.68 
 
 		 379 aa  355  8.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  49.73 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  49.73 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  47.38 
 
 		 390 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  46.92 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.14 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.26 
 
 		 406 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5935  amidohydrolase  47.34 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  47.45 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4353  amidohydrolase  45.67 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  46.88 
 
 		 392 aa  346  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  46.09 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  47.58 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  47.06 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  48 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  46.24 
 
 		 387 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  46.11 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  46.63 
 
 		 387 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  50.82 
 
 		 384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2598  peptidase M20D, amidohydrolase  49.74 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572475  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  48.12 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  45.7 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  44.89 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  45.7 
 
 		 387 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  45.97 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2229  amidohydrolase  47.14 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359386  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  44.89 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  47.85 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3206  amidohydrolase  43.65 
 
 		 389 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.057968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3314  amidohydrolase  47.98 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1301  amidohydrolase  45.1 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.855359 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  45.7 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  47.31 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  47.19 
 
 		 394 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  48.69 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4367  amidohydrolase  50.27 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  45.93 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2611  amidohydrolase  47.85 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  48.06 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  46.63 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4664  amidohydrolase  46.98 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0687549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  44.27 
 
 		 399 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  47.68 
 
 		 388 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  48.23 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  44.87 
 
 		 394 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  44.3 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  44.35 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5140  amidohydrolase  47.95 
 
 		 389 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  47.31 
 
 		 382 aa  328  9e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0044  peptidase M20D, amidohydrolase  49.32 
 
 		 385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  44.87 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5220  amidohydrolase  45.38 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  44.65 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2753  amidohydrolase  47.58 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114457  normal  0.226959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0719  peptidase M20D, amidohydrolase  47.04 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.093275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  44.59 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4062  amidohydrolase  47.53 
 
 		 387 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2692  amidohydrolase  48.64 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  44.87 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>