More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2759 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2759  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  93.73 
 
 		 311 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  94.06 
 
 		 311 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  94.06 
 
 		 311 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  93.73 
 
 		 311 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  94.54 
 
 		 311 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  76.25 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  77.26 
 
 		 376 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  77.26 
 
 		 312 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  76.92 
 
 		 312 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.67 
 
 		 311 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  73.33 
 
 		 330 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  77.02 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  77.02 
 
 		 272 aa  340  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  61.26 
 
 		 301 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0395  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.84 
 
 		 301 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0410  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.5 
 
 		 301 aa  328  9e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  61.36 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  62.03 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  49.51 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  49.51 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  49.02 
 
 		 308 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  49.02 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  48.69 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  48.73 
 
 		 310 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  49.5 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  47.33 
 
 		 315 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  50.16 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  48.47 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.35 
 
 		 299 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  46.31 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  50.85 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  47.46 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.46 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  45.3 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  48.55 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.48 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  45.33 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0122  hypothetical protein  47.46 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  41.89 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  44.15 
 
 		 317 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  43.15 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1123  hypothetical protein  46.28 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  36.45 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  46.4 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  35.12 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  35.59 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  40.86 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  40.53 
 
 		 314 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  37.46 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1801  hypothetical protein  40.5 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.655687 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0609  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  30.37 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.59 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  30.71 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.38 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  31.01 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.53 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.39 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2409  hypothetical protein  27.21 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.517139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  28.76 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  29.57 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  26.25 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  30.03 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  30.23 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.92 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.46 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.33 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.33 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.42 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.93 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  27.6 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  27.03 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  29.57 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.3 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  22.87 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  30.74 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  33.68 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.22 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  27.21 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  26.89 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.78 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.82 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.78 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.45 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>