107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1627 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  100 
 
 		 230 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0083  hypothetical protein  81.5 
 
 		 236 aa  380  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1503  hypothetical protein  81.94 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1283  hypothetical protein  81.06 
 
 		 236 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1586  hypothetical protein  80.62 
 
 		 236 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.728643  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1050  hypothetical protein  81.82 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0037  hypothetical protein  81.82 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0377  hypothetical protein  81.82 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1207  hypothetical protein  81.82 
 
 		 226 aa  367  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.87 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  25.93 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  26.78 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  33.64 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  26.52 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  33.64 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  33.64 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.71 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  26.78 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  34.23 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  34.42 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.73 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  27.67 
 
 		 192 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 218 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  28 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  29.73 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.15 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  27.72 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0124  thiol methyltransferase 1-like  29.05 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  34.91 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  31.43 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  30.71 
 
 		 1287 aa  45.4  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  30.48 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  27.71 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  27.94 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.28 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  27.72 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  23.81 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2575  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.73 
 
 		 383 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  31.76 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.48 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  32.71 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  25.38 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  27.69 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  27.78 
 
 		 208 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  27.21 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.19 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1752  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.73 
 
 		 383 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000168259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1858  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.73 
 
 		 383 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2564  hypothetical protein  20.56 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 		 279 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  28.3 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.06 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 252 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2192  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28.57 
 
 		 383 aa  42  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0331221  hitchhiker  0.00000592673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  27.49 
 
 		 220 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 241 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 196 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  25 
 
 		 264 aa  42  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3294  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 198 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.216078  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 733 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  31.54 
 
 		 291 aa  42  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1560  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  29.7 
 
 		 382 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>