More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3548 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  97.97 
 
 
297 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.89 
 
 
297 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  88.89 
 
 
297 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  88.89 
 
 
297 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.55 
 
 
297 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  74.07 
 
 
297 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.81 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.14 
 
 
296 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.53 
 
 
295 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.2 
 
 
293 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.02 
 
 
296 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  61.02 
 
 
303 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.74 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.7 
 
 
302 aa  318  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.27 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.95 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.57 
 
 
294 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.88 
 
 
296 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.86 
 
 
298 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.49 
 
 
292 aa  292  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.54 
 
 
297 aa  292  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.76 
 
 
298 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.08 
 
 
296 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.08 
 
 
296 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.08 
 
 
296 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.33 
 
 
307 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.84 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.85 
 
 
295 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.36 
 
 
328 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.86 
 
 
301 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.83 
 
 
299 aa  262  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.12 
 
 
323 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.03 
 
 
292 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.72 
 
 
293 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.66 
 
 
298 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  46.15 
 
 
321 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.86 
 
 
295 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  49.15 
 
 
295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  41.39 
 
 
297 aa  231  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.96 
 
 
294 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.68 
 
 
297 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  42.14 
 
 
321 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 
323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.64 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.13 
 
 
311 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  39.14 
 
 
301 aa  191  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  32.33 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.23 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
297 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
298 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  31.56 
 
 
300 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
303 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
303 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
291 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.49 
 
 
295 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
295 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
299 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
312 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  34.69 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.2 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.633416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.39 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1198  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.19 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0883945  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1105  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.19 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.481935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0857  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.01 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.741421  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.96 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1635  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.85 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.898557  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  32.19 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.116288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4932  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2099  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.24 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0931539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3049  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.98 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578152  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
347 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2924  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.98 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0488644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1280  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.98 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.55 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2237  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.98 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0976  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.98 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1263  dihydroflavonol-4-reductase family protein  30.98 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>