More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0400 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.48 
 
 
683 aa  898    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  94.39 
 
 
677 aa  1196    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  76.72 
 
 
669 aa  1011    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.66 
 
 
677 aa  989    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  100 
 
 
677 aa  1357    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  94.68 
 
 
677 aa  1207    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  80.69 
 
 
668 aa  989    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  71.96 
 
 
666 aa  933    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  79.12 
 
 
669 aa  1025    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  71.45 
 
 
666 aa  923    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  94.68 
 
 
677 aa  1207    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  79.28 
 
 
669 aa  1000    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  79.12 
 
 
672 aa  1000    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  79.28 
 
 
669 aa  1000    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  55.8 
 
 
659 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  55.04 
 
 
670 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.44 
 
 
672 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  57.82 
 
 
665 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.97 
 
 
668 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1391  putative C4-dicarboxylate transport sensor protein  88.06 
 
 
289 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0202  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  88.06 
 
 
289 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1390  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  95.29 
 
 
315 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0203  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  95.29 
 
 
315 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  43.95 
 
 
616 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  41.3 
 
 
623 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  42.03 
 
 
626 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
628 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  39.41 
 
 
630 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  39.33 
 
 
621 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  43.44 
 
 
638 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  39.3 
 
 
626 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
637 aa  362  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  38.18 
 
 
633 aa  360  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  38.47 
 
 
618 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  40.42 
 
 
634 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  37.44 
 
 
643 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  40.6 
 
 
602 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
634 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
634 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
621 aa  350  6e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  39.79 
 
 
621 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  36.27 
 
 
597 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  38.54 
 
 
627 aa  346  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
635 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
627 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
634 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  40.88 
 
 
591 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
634 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
623 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
634 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  39.15 
 
 
590 aa  342  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
638 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  36.8 
 
 
635 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  36.6 
 
 
643 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  36.35 
 
 
643 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  36.42 
 
 
643 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  39.04 
 
 
622 aa  340  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
631 aa  340  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
598 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  31.65 
 
 
598 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
598 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  38.95 
 
 
615 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
635 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
598 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  35.92 
 
 
600 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  39.29 
 
 
623 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  38.19 
 
 
600 aa  332  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 
652 aa  331  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  31.7 
 
 
603 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
603 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
627 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
603 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
603 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
604 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  35.95 
 
 
620 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  32.64 
 
 
600 aa  327  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.43 
 
 
597 aa  326  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  38.44 
 
 
622 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 
622 aa  324  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  38.93 
 
 
599 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  38.72 
 
 
612 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  40.42 
 
 
604 aa  323  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
585 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
621 aa  321  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  39.29 
 
 
603 aa  320  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  36.92 
 
 
585 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
585 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  37.03 
 
 
600 aa  317  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  37.65 
 
 
645 aa  317  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  35.39 
 
 
667 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
591 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  38.82 
 
 
604 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  38.35 
 
 
604 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  36.83 
 
 
586 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.18 
 
 
594 aa  310  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  36.75 
 
 
588 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  36.08 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
604 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  39.05 
 
 
604 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>