225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7676 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7676  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  100 
 
 		 136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4061  putative response regulator receiver protein  61.19 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.164869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0517  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  58.33 
 
 		 139 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355984  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4802  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3805  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 167 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3853  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.29 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1870  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3799  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  33.91 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1493  response regulator receiver  35.34 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1496  response regulator and cylclic diguanylate phosphodiesterase  35.04 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3857  response regulator receiver domain-containing protein  36.21 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2171  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32.23 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.189433  normal  0.293545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1876  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  35.24 
 
 		 416 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0529  putative response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2827  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0174  putative PAS/PAC sensor protein  28.45 
 
 		 498 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2365  two component signal transduction response regulator  32.8 
 
 		 575 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1285  response regulator receiver domain-containing protein  28.23 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0213798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 1195 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 1155 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3269  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 704 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.259657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 685 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0928  response regulator  32.41 
 
 		 518 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.581359 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1927  histidine kinase  31.52 
 
 		 775 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 653 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  31.71 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1214  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.678516  hitchhiker  0.000513941 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1479  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.62 
 
 		 445 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1141 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0012  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.7205  normal  0.156633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 705 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2785  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  27.42 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 479 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0693  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 639 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.91 
 
 		 461 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  26.27 
 
 		 849 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  35.42 
 
 		 1161 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 225 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  30.65 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4279  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.68 
 
 		 457 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0686  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.27 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000032274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  34.52 
 
 		 243 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  32.63 
 
 		 912 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.89 
 
 		 900 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1009 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2001  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1356 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0673  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.27 
 
 		 474 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3744  putative GAF sensor protein  26.12 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  34.02 
 
 		 219 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 737 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2843  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.75 
 
 		 547 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  27 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1177 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0538  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.22 
 
 		 473 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0102949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1010 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1183  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35 
 
 		 722 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0950  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 458 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00130546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1040  two-component response regulator  30.93 
 
 		 518 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.429651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1005 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  27.05 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  37.93 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 220 aa  43.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.17 
 
 		 456 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  27.78 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0750  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.55496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2427  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 707 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 		 931 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 657 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0187  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.23 
 
 		 457 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  27.05 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  32.05 
 
 		 224 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0753  sigma-54 dependent response regulator  26.77 
 
 		 387 aa  43.5  0.0009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01273  putative two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid  28.46 
 
 		 702 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.68 
 
 		 317 aa  43.5  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 819 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  32.05 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.25 
 
 		 650 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0870  response regulator receiver protein  36.05 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.226165  normal  0.635424 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 		 1145 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.18 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3776  response regulator receiver domain-containing protein  32.8 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 123 aa  42.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1322 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 1007 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3740  putative PAS/PAC sensor protein  24.39 
 
 		 1109 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 404 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  35 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0659  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1161 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2708  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 468 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.6 
 
 		 461 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>