More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5947 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  75.32 
 
 		 269 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  68.31 
 
 		 256 aa  318  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  63.56 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  58.13 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  57.72 
 
 		 249 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  64.49 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  59.92 
 
 		 239 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  62.1 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  64.65 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  64.65 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  55.38 
 
 		 265 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  53.46 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  52.92 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  60.19 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  60.66 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  60.66 
 
 		 242 aa  224  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  51.67 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  51.43 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  53.85 
 
 		 246 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  53.85 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  53.85 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  49.17 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  45.15 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  47.6 
 
 		 247 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  43.82 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  47.75 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.29 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 321 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.61 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  32.3 
 
 		 345 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.97 
 
 		 325 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.77 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 328 aa  151  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.04 
 
 		 312 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.77 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  34.2 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  41.41 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.4 
 
 		 323 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.37 
 
 		 312 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 		 310 aa  148  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.75 
 
 		 343 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  40.1 
 
 		 321 aa  146  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.32 
 
 		 330 aa  145  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  33.89 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.68 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.46 
 
 		 348 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35.16 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 339 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.53 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2896  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 339 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 334 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 		 321 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.61 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 329 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  36.1 
 
 		 245 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0997  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.09 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.37 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.01 
 
 		 310 aa  138  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  37.05 
 
 		 318 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.06 
 
 		 328 aa  138  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.93 
 
 		 333 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  36.28 
 
 		 250 aa  138  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  34.98 
 
 		 320 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  34.66 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  41.12 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.11 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  38.1 
 
 		 3786 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40 
 
 		 309 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.19 
 
 		 327 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  33.91 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 345 aa  135  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  39.45 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  37.27 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  40.89 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  33.78 
 
 		 319 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.79 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.66 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.09 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>