More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2586 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  100 
 
 
242 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  99.59 
 
 
242 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  92.56 
 
 
242 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  68.64 
 
 
239 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  58.92 
 
 
249 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  57.92 
 
 
249 aa  248  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  58.13 
 
 
253 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  57.47 
 
 
249 aa  246  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  55.14 
 
 
249 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  57.76 
 
 
265 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  54.51 
 
 
256 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  56.52 
 
 
249 aa  241  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  56.03 
 
 
264 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  52.56 
 
 
242 aa  222  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  49.58 
 
 
239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  52.34 
 
 
272 aa  208  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.66 
 
 
259 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  51.02 
 
 
250 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  56.94 
 
 
269 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  48.12 
 
 
255 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 
247 aa  191  7e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  47.25 
 
 
247 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
251 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  43.16 
 
 
285 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  47.66 
 
 
246 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  47.03 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  44.35 
 
 
237 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  42.72 
 
 
239 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 
345 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.02 
 
 
326 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 
249 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 
239 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.4 
 
 
325 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
266 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.43 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.95 
 
 
330 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
317 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 
325 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.32 
 
 
324 aa  161  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 
338 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.48 
 
 
316 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.52 
 
 
326 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.46 
 
 
334 aa  158  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  40.28 
 
 
330 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.04 
 
 
324 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.93 
 
 
339 aa  155  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  38.97 
 
 
327 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 
323 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.81 
 
 
324 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
328 aa  150  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.48 
 
 
308 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
318 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  39.74 
 
 
352 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  40.86 
 
 
300 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.75 
 
 
333 aa  149  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.05 
 
 
334 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.23 
 
 
325 aa  148  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.37 
 
 
310 aa  148  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
262 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  37 
 
 
315 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 
308 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  37.28 
 
 
321 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  37 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  38.99 
 
 
309 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
352 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.71 
 
 
323 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.93 
 
 
321 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  38.43 
 
 
352 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.25 
 
 
327 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 
348 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  35.65 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.22 
 
 
337 aa  144  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.45 
 
 
339 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  40.27 
 
 
387 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  34.82 
 
 
320 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.81 
 
 
315 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
333 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  43.22 
 
 
304 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  43.22 
 
 
304 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 
324 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 
334 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
323 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  37.55 
 
 
333 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
333 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 
334 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
333 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 
380 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 
340 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  37.12 
 
 
333 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2364  ABC transporter related  41.04 
 
 
327 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021349  normal  0.0168897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.02 
 
 
305 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
366 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  34.15 
 
 
510 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  40.93 
 
 
312 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  37.34 
 
 
275 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>