More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3135 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  96.75 
 
 		 246 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  96.34 
 
 		 246 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  71.73 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  54.36 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  54.62 
 
 		 242 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  53.22 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  51.68 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  52.52 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  51.68 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  53.5 
 
 		 265 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  53.72 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  51.46 
 
 		 255 aa  224  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  51.03 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  51.45 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  54.39 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  55.74 
 
 		 269 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  52.94 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  52.1 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  48.31 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  49.58 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  47.41 
 
 		 285 aa  199  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  48.18 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  48.46 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  48.51 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  47.66 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.59 
 
 		 323 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  43.17 
 
 		 282 aa  168  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.2 
 
 		 338 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 		 325 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 		 345 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.17 
 
 		 324 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 		 325 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.55 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  36.28 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.65 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.1 
 
 		 339 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.38 
 
 		 312 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.07 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.67 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.4 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.21 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 		 321 aa  148  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.75 
 
 		 324 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.56 
 
 		 326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  43.91 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.94 
 
 		 327 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.19 
 
 		 327 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  34.5 
 
 		 312 aa  145  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.87 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.18 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.3 
 
 		 330 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.74 
 
 		 327 aa  143  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.02 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.75 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.88 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.43 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  35.71 
 
 		 300 aa  141  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.5 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 1171 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.75 
 
 		 322 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 330 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 305 aa  138  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.82 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0949  ABC transporter-related protein  42.48 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 		 328 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  37.22 
 
 		 304 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  37.22 
 
 		 304 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 		 329 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 		 579 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.65 
 
 		 317 aa  134  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  41.2 
 
 		 665 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  34.84 
 
 		 304 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  30.67 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2498  ABC transporter component  39.83 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.497129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0951  ABC transporter related  42.92 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  32.07 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.02 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  31.92 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>