More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0248 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  100 
 
 		 269 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.79 
 
 		 259 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  63.11 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  60.7 
 
 		 264 aa  278  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  57.2 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  56.78 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  60 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  58.65 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  56.49 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  56.25 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  55.16 
 
 		 265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  54.03 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  56.91 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  52.89 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  49.19 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  55.46 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  52.1 
 
 		 242 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  55 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  55 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  52.74 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  56.02 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  56.48 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  56.48 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  45.92 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  42.7 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  45.11 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  44.69 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.26 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  35.14 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  40.34 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.81 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  39.5 
 
 		 315 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.41 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.79 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  37.05 
 
 		 321 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 		 326 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.77 
 
 		 324 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.26 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 		 325 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 338 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.35 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.35 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 330 aa  152  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.67 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.3 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  40.76 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.24 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  36.99 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 		 327 aa  148  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  42.42 
 
 		 300 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.3 
 
 		 334 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 334 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.89 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 328 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.44 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  37.5 
 
 		 307 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  37.89 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 311 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.51 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.91 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0997  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  39.45 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  39.45 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 541 aa  144  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.79 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  32.13 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  38.29 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 310 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  34.47 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.45 
 
 		 330 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 305 aa  142  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 311 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  35.9 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>