More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0009 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  70.29 
 
 		 264 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.31 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  63.98 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  58.44 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  56 
 
 		 253 aa  255  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  55.65 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  56.2 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  55.65 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  56.72 
 
 		 249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  58.18 
 
 		 249 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  52.45 
 
 		 265 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  53.59 
 
 		 242 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  54.13 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  54.58 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  54.43 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  54.51 
 
 		 242 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  55 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  48.95 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  52.08 
 
 		 272 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  44.23 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  45.06 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  44.8 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  46.55 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  48.31 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  48.31 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  48.31 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  45.95 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  42.92 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 		 321 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 		 324 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.32 
 
 		 323 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.94 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.12 
 
 		 326 aa  154  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.39 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.05 
 
 		 324 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.47 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  34.91 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.61 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 		 343 aa  149  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.94 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.43 
 
 		 323 aa  148  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.1 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 330 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.55 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.51 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  35.74 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 339 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.56 
 
 		 333 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 330 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  38.78 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 		 324 aa  141  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 		 324 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.48 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  39.8 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3169  ABC transporter, ATPase subunit  36.13 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.386052  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.56 
 
 		 323 aa  139  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.17 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  39.8 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.57 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  32.74 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.51 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  37.29 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 340 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  35.05 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.88 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.19 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.78 
 
 		 327 aa  135  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.48 
 
 		 327 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 		 334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.72 
 
 		 328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.6 
 
 		 339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.83 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  36.16 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3286  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.874938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3360  ABC transporter related  35.71 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.05 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  38.14 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  31.71 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  32.95 
 
 		 901 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  32.95 
 
 		 901 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0997  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.89 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  33.79 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>