More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2260 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  51.78 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  50.64 
 
 		 239 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  50.44 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  53.22 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  53.22 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  50.64 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  48.64 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  47.35 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  45.06 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  44.64 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  44.73 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  45.33 
 
 		 249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  46.89 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  43.52 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  42.98 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  43.06 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  43.52 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  43.35 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  43.44 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  43.89 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  45.92 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  43.75 
 
 		 255 aa  178  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.15 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  44.29 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.82 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 317 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 		 242 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  42.25 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  42.13 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.43 
 
 		 317 aa  151  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.85 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  38.57 
 
 		 300 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 		 325 aa  149  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.12 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.16 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 		 338 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.61 
 
 		 326 aa  148  9e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 		 325 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  38.1 
 
 		 260 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.44 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.44 
 
 		 339 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 		 326 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.48 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.59 
 
 		 339 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.71 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.07 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.56 
 
 		 328 aa  143  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  36.4 
 
 		 310 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.04 
 
 		 321 aa  142  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 262 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  39.13 
 
 		 321 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  41.3 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.13 
 
 		 320 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 312 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.13 
 
 		 320 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.48 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.39 
 
 		 311 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  38.86 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  38.86 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  38.03 
 
 		 345 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.59 
 
 		 312 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 315 aa  141  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.51 
 
 		 333 aa  141  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  38.43 
 
 		 320 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.32 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.18 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  38.7 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  38.26 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.52 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  38.21 
 
 		 665 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  37.39 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  39.46 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 		 345 aa  139  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35.55 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  38.43 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  38.43 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 		 330 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  38.43 
 
 		 373 aa  138  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  37.72 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 		 348 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  38.1 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  36.12 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  38.1 
 
 		 309 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 		 317 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  35.53 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.56 
 
 		 328 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.57 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>