More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2717 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2717  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.274453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2185  ABC transporter related  83.95 
 
 
249 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.254877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1850  ABC transporter related  83.13 
 
 
249 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1801  ABC transporter related  84.23 
 
 
249 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.703769  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5313  ABC transporter related  76.23 
 
 
249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5009  ABC transporter related  76.73 
 
 
253 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107476  normal  0.110297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0029  ABC transporter related  62.03 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0026  ABC transporter related  64.75 
 
 
265 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0009  ABC transporter related  56.2 
 
 
256 aa  245  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0009  ABC transporter related  55.24 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065566  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5947  putative ABC transporter ATP-binding protein  64.49 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212868  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2667  ABC transporter  51.69 
 
 
239 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0248  ABC transporter related  58.3 
 
 
269 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  51.91 
 
 
242 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2586  ABC multidrug efflux transporter, ATPase subunit  55.14 
 
 
242 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1946  ABC transporter related  53.81 
 
 
272 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1244  ABC transporter related  55.14 
 
 
242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.184068  normal  0.743108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1937  ABC transporter related  56.83 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2849  ABC transporter related  49.39 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.372779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1280  ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
247 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4976  ABC transporter related  48.85 
 
 
255 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.351219  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3135  ABC transporter related  51.03 
 
 
246 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1860  ABC transporter related  45.22 
 
 
285 aa  198  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1793  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000464177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2668  efflux ABC transporter ATP-binding protein  50.62 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3095  ABC transporter related  50.62 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2260  ABC transporter related  45.33 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.502065  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
251 aa  195  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3039  ABC transporter related  46.7 
 
 
237 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2589  ABC efflux transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486722  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  41.15 
 
 
247 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  38.56 
 
 
266 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 
323 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 
326 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  42.17 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.19 
 
 
326 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  43.29 
 
 
309 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
317 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 
343 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.94 
 
 
325 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.77 
 
 
323 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.04 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.98 
 
 
330 aa  161  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  37.84 
 
 
260 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.84 
 
 
328 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
330 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
315 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  40.69 
 
 
300 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
321 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  43.28 
 
 
321 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.98 
 
 
305 aa  158  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 
310 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  44.5 
 
 
315 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 
323 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 
325 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 
324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.68 
 
 
324 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.1 
 
 
327 aa  154  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  45 
 
 
308 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  46.91 
 
 
245 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.2 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.04 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  37.27 
 
 
320 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.69 
 
 
339 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.04 
 
 
345 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 
305 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 
329 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.78 
 
 
305 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 
305 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.31 
 
 
325 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
339 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  41.67 
 
 
304 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.05 
 
 
327 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.04 
 
 
338 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  41.79 
 
 
320 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.18 
 
 
308 aa  148  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  40.37 
 
 
304 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
323 aa  148  9e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  42.64 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  42.64 
 
 
304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.23 
 
 
324 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  36.57 
 
 
321 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.44 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.72 
 
 
320 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  40.31 
 
 
330 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  41.63 
 
 
307 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
313 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 
321 aa  146  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2252  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
334 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610226  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2057  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
340 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2112  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
334 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  38.77 
 
 
339 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2327  ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
325 aa  145  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 
318 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  38 
 
 
311 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>