More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0754 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0754  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  59.58 
 
 		 262 aa  289  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  51.01 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5369  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 341 aa  244  9e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  50.21 
 
 		 311 aa  242  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  52.91 
 
 		 307 aa  241  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  52.68 
 
 		 320 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  52.02 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 305 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  54.19 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  52.02 
 
 		 312 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  51.57 
 
 		 312 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 		 319 aa  236  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  48.95 
 
 		 312 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  52.47 
 
 		 310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2827  ABC transporter related  52.27 
 
 		 306 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00126  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  51.36 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3475  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3532  ABC transporter related  51.36 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0131  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0137  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00125  hypothetical protein  51.36 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0129  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  50.84 
 
 		 239 aa  234  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  50.64 
 
 		 355 aa  234  8e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03455  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 324 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0135  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  53.3 
 
 		 315 aa  232  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  52.23 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  50.2 
 
 		 298 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  53.3 
 
 		 315 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  52.04 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0653  ABC transporter related  48.13 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.860954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 308 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 308 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0191  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 308 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.503646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 308 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  50.22 
 
 		 312 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  51.36 
 
 		 326 aa  231  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  50.22 
 
 		 312 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  50.22 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  52.47 
 
 		 336 aa  230  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  50.22 
 
 		 312 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  51.36 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0120  ABC transporter, ATP-binding protein  50.91 
 
 		 308 aa  230  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  51.97 
 
 		 316 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  49.34 
 
 		 318 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  49.78 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  53.25 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  53.25 
 
 		 309 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3477  ABC transporter related  51.12 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3349  ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  52.47 
 
 		 308 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  51.12 
 
 		 307 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  48.18 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  51.34 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  51.82 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  53.3 
 
 		 309 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  52.81 
 
 		 309 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  50.22 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  48.32 
 
 		 310 aa  224  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  50.89 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  50.87 
 
 		 308 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  49.77 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  49.55 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  49.55 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  50.87 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3122  ABC transporter related  50.45 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  50.87 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  51.42 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  51.34 
 
 		 307 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  50.87 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  49.77 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  52.19 
 
 		 312 aa  222  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  49.78 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  50 
 
 		 307 aa  222  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  49.09 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  47.76 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  50.87 
 
 		 308 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  50.23 
 
 		 310 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  49.77 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  48.48 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 		 331 aa  221  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 		 319 aa  221  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  51.12 
 
 		 310 aa  221  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 		 343 aa  221  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  50.66 
 
 		 316 aa  221  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  51.57 
 
 		 305 aa  221  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  50.67 
 
 		 306 aa  221  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 306 aa  221  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>