159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4525 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4525  putative outer-membrane protein  100 
 
 		 257 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  51.98 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1567  putative outer-membrane protein precursor  50.78 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  50.2 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3155  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  48.21 
 
 		 246 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1543  putative outer-membrane protein  49.37 
 
 		 258 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2714  outer membrane protein  50.23 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155382  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2756  putative outer membrane protein  50.68 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4376  putative outer-membrane protein  47.81 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36541  normal  0.0609964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2756  putative outer membrane protein  47.41 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841875  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2763  putative outer-membrane protein precursor  49.32 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.285911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2080  putative outer-membrane protein precursor  50.67 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3614  putative outer membrane protein  43.03 
 
 		 235 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  33.2 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  35.74 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  37.6 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  37.28 
 
 		 997 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  37.85 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  36.48 
 
 		 447 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  35.83 
 
 		 236 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2145  outer membrane protein  37.95 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.225218  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  36.15 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  34.39 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.2 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  34.24 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  35.14 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  34.14 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  33.8 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  28.73 
 
 		 566 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4374  putative outer-membrane protein  36.4 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  35.34 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  31.3 
 
 		 570 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1666  OmpA-like transmembrane region  37.39 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  33.92 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  34.27 
 
 		 561 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  32.27 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  29.17 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4401  OmpA-like transmembrane region  32.07 
 
 		 559 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  28.17 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  28.64 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  33.33 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  31.22 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  29.11 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0733  outer membrane protein  33.72 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.130321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4691  hypothetical protein  29.51 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2788  hypothetical protein  31.43 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0959536  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  33.85 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.91 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  33.47 
 
 		 692 aa  76.3  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0473  Carbohydrate-selective porin OprB  31.92 
 
 		 689 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.693985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  34.68 
 
 		 449 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  33.46 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0901  outer membrane autotransporter  31.74 
 
 		 638 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2567  hypothetical protein  29.84 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2845  outer membrane autotransporter barrel  27.57 
 
 		 652 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  33.87 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  29.96 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  31.58 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  34.47 
 
 		 206 aa  72  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  29 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1337  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0567  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  33.01 
 
 		 661 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  29.07 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  30 
 
 		 645 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3564  carbohydrate-selective porin OprB  30 
 
 		 724 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.09 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4249  Carbohydrate-selective porin OprB  30.09 
 
 		 670 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7235  putative outer membrane protein  33.89 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0329  carbohydrate-selective porin OprB  34.62 
 
 		 674 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  29.24 
 
 		 693 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.09 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  28.32 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  35 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  32.86 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  27.96 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7486  OmpA domain-containing protein  30.97 
 
 		 662 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  30 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  36.11 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  36.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  30.45 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  31.54 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  36.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  29.5 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  29.46 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  28.98 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  29.64 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1908  hypothetical protein  32.86 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.807781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  27.13 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  28.37 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  26.55 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.77 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  27.88 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  28.06 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  31.49 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  26.69 
 
 		 571 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  36.26 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  36.26 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  28.42 
 
 		 583 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3804  carbohydrate-selective porin OprB  27.07 
 
 		 708 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0335542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  27.24 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>