More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4275 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  100 
 
 		 224 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  79.82 
 
 		 224 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  79.37 
 
 		 224 aa  359  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  78.92 
 
 		 224 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  78.92 
 
 		 224 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  78.48 
 
 		 224 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  78.48 
 
 		 224 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  77.58 
 
 		 224 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  76.92 
 
 		 225 aa  349  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  77.13 
 
 		 224 aa  348  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  77.13 
 
 		 224 aa  345  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  75.89 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  76.23 
 
 		 224 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  74.55 
 
 		 224 aa  338  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  71.95 
 
 		 233 aa  328  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  79.02 
 
 		 224 aa  327  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  78.57 
 
 		 224 aa  327  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  78.12 
 
 		 224 aa  323  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  71.04 
 
 		 232 aa  312  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  60.09 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  59.19 
 
 		 224 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  63.13 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  39.63 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  44.5 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  38.96 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4850  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.16 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0298674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2776  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3439  HAD family hydrolase  34.25 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1750  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.85 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428028  normal  0.0347073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0228  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.62 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424895  hitchhiker  0.00464716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1880  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.615565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.63 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.86 
 
 		 223 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.13 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.88 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  34.12 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  36.06 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.55 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.97 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.43 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3915  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  34.51 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.59 
 
 		 260 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  28.3 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.15 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  30.73 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  32.24 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2682  putative phosphatase  35.48 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2574  putative phosphatase  35.48 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2474  putative phosphatase  35.48 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764335  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2519  putative phosphatase  35.48 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0435339  normal  0.279321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2562  putative phosphatase  35.48 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.34 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  35.52 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  34.62 
 
 		 762 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  35.52 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  35.52 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.52 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  35.52 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  29.44 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  32.98 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.94 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  28.91 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 209 aa  72  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.09 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.64 
 
 		 735 aa  71.6  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.52 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.56 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4663  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.828051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  33.87 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  30.11 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.97 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  34.95 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.95 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  30 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  33.87 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  27.11 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  34.95 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  34.95 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  31.43 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  34.95 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  34.95 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  34.72 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  31.75 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.52 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.05 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.25 
 
 		 456 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  34.41 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.13 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>