More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3974 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75 
 
 
472 aa  684    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  74.8 
 
 
483 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  73.47 
 
 
516 aa  714    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 
478 aa  960    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  75.75 
 
 
503 aa  710    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  73.11 
 
 
500 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  75.15 
 
 
487 aa  675    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.32 
 
 
519 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.32 
 
 
519 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.44 
 
 
501 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.29 
 
 
527 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  79.14 
 
 
465 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  79.13 
 
 
537 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.6 
 
 
482 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.58 
 
 
484 aa  594  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.5 
 
 
494 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  66.14 
 
 
477 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.15 
 
 
499 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.96 
 
 
498 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.77 
 
 
505 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.67 
 
 
521 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  63.56 
 
 
482 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  63.56 
 
 
482 aa  547  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.05 
 
 
462 aa  542  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  66 
 
 
516 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.1 
 
 
504 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  64.04 
 
 
518 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.04 
 
 
516 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.22 
 
 
507 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.64 
 
 
493 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.07 
 
 
498 aa  482  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.95 
 
 
503 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.15 
 
 
678 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  62.96 
 
 
644 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  56.38 
 
 
493 aa  472  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  54.72 
 
 
799 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.97 
 
 
458 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.88 
 
 
555 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  57.65 
 
 
464 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.43 
 
 
448 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.52 
 
 
487 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 
482 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  51.08 
 
 
559 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.81 
 
 
489 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.08 
 
 
482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.62 
 
 
489 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  51.08 
 
 
482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.8 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  49.01 
 
 
492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  51.08 
 
 
481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.08 
 
 
482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  51.08 
 
 
482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  51.08 
 
 
482 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.17 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 
497 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.62 
 
 
511 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  51.08 
 
 
491 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.63 
 
 
520 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  51.89 
 
 
527 aa  353  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  51.63 
 
 
520 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.63 
 
 
520 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49 
 
 
486 aa  352  8.999999999999999e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.92 
 
 
511 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  47.31 
 
 
398 aa  347  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.09 
 
 
540 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.53 
 
 
494 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  52.04 
 
 
506 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  45.5 
 
 
510 aa  345  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.12 
 
 
513 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.37 
 
 
484 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.37 
 
 
484 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.26 
 
 
491 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.92 
 
 
504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.68 
 
 
515 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.7 
 
 
533 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.13 
 
 
479 aa  342  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.07 
 
 
526 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.46 
 
 
629 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  49.33 
 
 
494 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  43.6 
 
 
445 aa  340  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.81 
 
 
537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
525 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  44.24 
 
 
557 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.04 
 
 
525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.72 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  41.88 
 
 
629 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.66 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.49 
 
 
515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.49 
 
 
515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.9 
 
 
486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.06 
 
 
403 aa  336  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.54 
 
 
496 aa  336  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.6 
 
 
493 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  42.98 
 
 
506 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.37 
 
 
477 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  44.37 
 
 
477 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.86 
 
 
493 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.98 
 
 
556 aa  335  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.39 
 
 
443 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.17 
 
 
545 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>