More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0529 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0529  putative response regulator receiver protein  100 
 
 		 169 aa  333  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3805  response regulator receiver domain-containing protein  63.24 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1870  response regulator receiver protein  60.63 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3857  response regulator receiver domain-containing protein  60.61 
 
 		 165 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1493  response regulator receiver  62.12 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3853  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  39.52 
 
 		 417 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1496  response regulator and cylclic diguanylate phosphodiesterase  46.22 
 
 		 413 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4802  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4061  putative response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.164869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.87 
 
 		 1535 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3799  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  40.87 
 
 		 415 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 513 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 483 aa  61.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0517  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  35.83 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355984  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 496 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1361  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  35.07 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 682 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  34.58 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0812  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257022  hitchhiker  0.00000328811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2109  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.14 
 
 		 515 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0958  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.17 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1498  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 500 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0380  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1876  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  36.84 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7676  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  36.29 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0260  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.63 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  30.53 
 
 		 1040 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 823 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.31 
 
 		 481 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1479  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.62 
 
 		 445 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0662  helix-turn-helix, Fis-type  34 
 
 		 451 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 474 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3090  Fis family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 560 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  33.86 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4129  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 485 aa  55.1  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.91 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1129  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  27.83 
 
 		 453 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.87 
 
 		 772 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0446  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 481 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0247  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  33.33 
 
 		 485 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898521  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1005 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  32.05 
 
 		 230 aa  53.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 462 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1940  response regulator  28.33 
 
 		 397 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2943  helix-turn-helix, Fis-type  31.67 
 
 		 529 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0374645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  27.7 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 552 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4553  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.130056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1574  nitrogen assimilation regulator receiver protein  34.55 
 
 		 454 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.281869  normal  0.0357096 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  33.09 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  38.16 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.65 
 
 		 238 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  34.52 
 
 		 126 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  30.66 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3161  response regulator  40.24 
 
 		 576 aa  52.4  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  31.45 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3216  type IV pilus expression regulatory protein  30.56 
 
 		 537 aa  52.4  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0199  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 		 451 aa  52.4  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.940712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1588  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 458 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 642 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.17 
 
 		 502 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.55 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1176  hypothetical protein  29.6 
 
 		 442 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1182  hypothetical protein  29.6 
 
 		 442 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  32.74 
 
 		 239 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3630  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 502 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.670707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  29.46 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  35.79 
 
 		 236 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3383  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 475 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1179  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 457 aa  51.6  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.655382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 794 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0590  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  24.48 
 
 		 440 aa  51.2  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 231 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 685 aa  51.2  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.04 
 
 		 440 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 977 aa  51.2  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  30.36 
 
 		 356 aa  51.2  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 231 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  34.67 
 
 		 667 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8520  response regulator receiver protein  45.31 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3047  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  30.63 
 
 		 490 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2820  nitrogen regulation protein NR(I)  30.63 
 
 		 490 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122991  normal  0.465253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3052  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.83 
 
 		 541 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1488  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 455 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.25 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0358  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2642  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.83 
 
 		 542 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1618  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  33.04 
 
 		 486 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1456  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 455 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal  0.178058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 532 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>