91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01892 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01892  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2845  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 715 aa  204  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  49.47 
 
 		 722 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1518  TonB-dependent receptor plug  58.46 
 
 		 727 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2198  IS1 protein InsB  37.12 
 
 		 195 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0151864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1087  lyase  73.68 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 663 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.41 
 
 		 663 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.41 
 
 		 663 aa  52  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  42.03 
 
 		 650 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  42.03 
 
 		 650 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  42.03 
 
 		 650 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  42.03 
 
 		 650 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.41 
 
 		 663 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.41 
 
 		 663 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  42.03 
 
 		 650 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.41 
 
 		 663 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  34.41 
 
 		 659 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  40.58 
 
 		 641 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.07 
 
 		 656 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  31.68 
 
 		 655 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  35.06 
 
 		 680 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 818 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 715 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 		 653 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 841 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 648 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 664 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 844 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 893 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  34.78 
 
 		 713 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 615 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 700 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 613 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.88 
 
 		 638 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 641 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 657 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.57 
 
 		 696 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  33.73 
 
 		 617 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  34.69 
 
 		 714 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  35.71 
 
 		 665 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  30.38 
 
 		 681 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  27.27 
 
 		 656 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  30.93 
 
 		 666 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 726 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3327  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.51 
 
 		 688 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0926253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  29.52 
 
 		 694 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  33.85 
 
 		 1023 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 929 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1741  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  26.09 
 
 		 661 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000016514  normal  0.0458944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  29.9 
 
 		 666 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 593 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3802  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  29.23 
 
 		 660 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.241464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  32.22 
 
 		 623 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  27.96 
 
 		 665 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  27.59 
 
 		 702 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  27.96 
 
 		 665 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  27.96 
 
 		 665 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  29.9 
 
 		 666 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4857  outer membrane heme/hemoglobin receptor ChuA  29.23 
 
 		 660 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.803267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0859  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  29.79 
 
 		 676 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  29.9 
 
 		 666 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  36.11 
 
 		 706 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  30.67 
 
 		 739 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.18 
 
 		 614 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  29.21 
 
 		 696 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  31.96 
 
 		 959 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12613  normal  0.0122478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 700 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  34.18 
 
 		 614 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.18 
 
 		 614 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.18 
 
 		 614 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.18 
 
 		 614 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  26.19 
 
 		 862 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 617 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  34.18 
 
 		 614 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  33.75 
 
 		 676 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0993  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 826 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  30.86 
 
 		 687 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.1 
 
 		 614 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 790 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 645 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05128  hypothetical protein  30.43 
 
 		 458 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  34.67 
 
 		 788 aa  40  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  28.57 
 
 		 675 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2036  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 687 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2462  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 724 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 802 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.65 
 
 		 614 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 653 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.65 
 
 		 614 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  28.87 
 
 		 666 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>