More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29930 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  100 
 
 		 613 aa  1228    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  48.38 
 
 		 571 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  39.59 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  42.99 
 
 		 600 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  33.51 
 
 		 586 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  39.21 
 
 		 625 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  34.74 
 
 		 576 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  37.74 
 
 		 600 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  33.22 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  37.16 
 
 		 603 aa  316  8e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  37.08 
 
 		 628 aa  311  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  35.09 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1383  ATPase  32.59 
 
 		 614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  33.45 
 
 		 605 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 594 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  34.14 
 
 		 583 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 599 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.23 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  30.57 
 
 		 552 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  34.02 
 
 		 568 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  33.75 
 
 		 586 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  33.75 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  34.62 
 
 		 596 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  34.42 
 
 		 583 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  33.87 
 
 		 585 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.55 
 
 		 610 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  30.27 
 
 		 610 aa  249  9e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  29.94 
 
 		 611 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  29.94 
 
 		 611 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  28.82 
 
 		 601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 601 aa  239  9e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  31.76 
 
 		 612 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  26.3 
 
 		 564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.17 
 
 		 564 aa  227  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  34.76 
 
 		 585 aa  226  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.37 
 
 		 564 aa  223  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  33.2 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  33.5 
 
 		 610 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  29.01 
 
 		 603 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2971  hypothetical protein  26.99 
 
 		 610 aa  220  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.570189  normal  0.54511 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  28.39 
 
 		 613 aa  220  6e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  36.47 
 
 		 613 aa  220  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.2 
 
 		 564 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  29.52 
 
 		 606 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  33.94 
 
 		 626 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  30.92 
 
 		 727 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  31.73 
 
 		 606 aa  200  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  29.85 
 
 		 603 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.57 
 
 		 700 aa  193  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.08 
 
 		 592 aa  193  7e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.65 
 
 		 590 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  28.17 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  29.21 
 
 		 586 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.52 
 
 		 574 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  28.92 
 
 		 632 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.31 
 
 		 574 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4581  ABC transporter related  33.84 
 
 		 613 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  30.49 
 
 		 590 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  28.92 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  27.59 
 
 		 607 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3308  ABC transporter related  37.33 
 
 		 587 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1134  ABC transporter related  33.03 
 
 		 600 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 		 592 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0325  ABC transporter, transmembrane region  31.34 
 
 		 746 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.771448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.98 
 
 		 586 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.04 
 
 		 600 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4147  ABC transporter-like  36.33 
 
 		 633 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593433  normal  0.175758 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 634 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  31.22 
 
 		 592 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  41.8 
 
 		 641 aa  184  6e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.76 
 
 		 590 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.21 
 
 		 571 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  27.79 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  31.85 
 
 		 585 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30 
 
 		 575 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  29.35 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2343  ABC transporter related  32.19 
 
 		 591 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal  0.0107518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1001  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 593 aa  182  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  29.31 
 
 		 1003 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  30.43 
 
 		 639 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.43 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.41 
 
 		 717 aa  181  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  31.37 
 
 		 594 aa  180  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  29.96 
 
 		 582 aa  180  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.04 
 
 		 587 aa  180  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.94 
 
 		 588 aa  180  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0811  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.73 
 
 		 551 aa  180  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  43.56 
 
 		 598 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  25.38 
 
 		 581 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1260  hypothetical protein  30.63 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.678722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.31 
 
 		 613 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  31.1 
 
 		 712 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  38.7 
 
 		 601 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  30.85 
 
 		 612 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  31.1 
 
 		 712 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.77 
 
 		 578 aa  179  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.83 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  26.3 
 
 		 566 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.44 
 
 		 597 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>