256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4244 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  73.21 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  71.88 
 
 		 223 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  67.26 
 
 		 226 aa  281  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  61.36 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  60.35 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  54.5 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  55.41 
 
 		 222 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  60.09 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  54.71 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  54.67 
 
 		 222 aa  235  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  54.26 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  52.91 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  54.26 
 
 		 224 aa  231  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  59.82 
 
 		 223 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  53.36 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  53.81 
 
 		 224 aa  227  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  54.21 
 
 		 219 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.46 
 
 		 222 aa  224  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  53.46 
 
 		 222 aa  224  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.55 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  52.97 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.6 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  49.09 
 
 		 221 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.17 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  45.62 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  46.92 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  46.12 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.04 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.12 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.91 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  45.91 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.98 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  43.84 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  45 
 
 		 222 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.28 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  41.75 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  40.95 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  40.2 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  44.28 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.91 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  37.43 
 
 		 167 aa  95.5  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 828 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  37.38 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  37.38 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  37.38 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  36.11 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  27.32 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.58 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.68 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 835 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 835 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.86 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.44 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  25.69 
 
 		 833 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  29.84 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  28.45 
 
 		 843 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.36 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  37.04 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  35.71 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  30.73 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  31.01 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  26.06 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.12 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  38.32 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  30.6 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  32.23 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  25.53 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.27 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.68 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  25.25 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  31.13 
 
 		 817 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  28.36 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  31.48 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.36 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.36 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  32.32 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 		 810 aa  55.8  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  30.56 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  27.96 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  28.5 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  27.72 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.26 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.46 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  34.26 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.28 
 
 		 786 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.71 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  34.91 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  32.41 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.67 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 788 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.76 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  30.37 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 788 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  32.76 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  28.5 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>