More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3943 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4600  ABC transporter related  55.73 
 
 		 903 aa  994    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.680396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5980  ABC transporter related  55.27 
 
 		 904 aa  1007    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7130  ABC transporter related  54.63 
 
 		 904 aa  1007    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.444817 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5606  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.28 
 
 		 904 aa  988    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3943  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 906 aa  1840    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2720  hypothetical protein  39.18 
 
 		 962 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.617854  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4404  ABC transporter ATP-binding protein-like protein  39.14 
 
 		 943 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3370  putative multidrug ABC transporter, ATP-binding and permease protein  37.38 
 
 		 882 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0532146 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3676  cyclic nucleotide-binding protein  30.85 
 
 		 1043 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2678  cyclic nucleotide-binding protein  29.26 
 
 		 1017 aa  345  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0916435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3250  ABC transporter related  25.65 
 
 		 831 aa  301  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1893  ABC transporter ATP-binding protein  28.72 
 
 		 887 aa  278  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0349  ABC transporter related  23.68 
 
 		 828 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0722  ATPase  24.48 
 
 		 834 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4031  ABC transporter related  24.25 
 
 		 833 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.849006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4972  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  27.07 
 
 		 867 aa  178  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0604795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2335  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.03 
 
 		 901 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345042  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1045  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  26.73 
 
 		 861 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404163  normal  0.666922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4922  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  26.8 
 
 		 867 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4458  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  26.99 
 
 		 869 aa  164  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0275  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.51 
 
 		 901 aa  161  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2552  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  29.41 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263362  normal  0.0193136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  23.9 
 
 		 687 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6102  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  22.74 
 
 		 357 aa  94.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0139556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.44 
 
 		 1000 aa  92.4  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  20.5 
 
 		 566 aa  92  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  20.05 
 
 		 566 aa  92  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  22.19 
 
 		 622 aa  91.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2015  ABC transporter related  19.7 
 
 		 631 aa  90.5  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.945643  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.88 
 
 		 614 aa  90.1  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  21.24 
 
 		 586 aa  89.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  23.7 
 
 		 631 aa  88.6  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  25.56 
 
 		 930 aa  88.2  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  22.91 
 
 		 620 aa  87.8  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  19.66 
 
 		 600 aa  87.8  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  23.56 
 
 		 980 aa  87.4  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  21.71 
 
 		 611 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  22.27 
 
 		 648 aa  86.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  23.25 
 
 		 654 aa  86.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  21.86 
 
 		 629 aa  85.5  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  22.74 
 
 		 1024 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  22.33 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  25.65 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.47 
 
 		 1008 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.47 
 
 		 1008 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  22.79 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  22.79 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  22.44 
 
 		 975 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  24.47 
 
 		 612 aa  82.8  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  22.43 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  20.84 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  23.77 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  23.61 
 
 		 628 aa  82  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  22.31 
 
 		 765 aa  81.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  22.55 
 
 		 611 aa  82  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  21.41 
 
 		 580 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  19.19 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  22.59 
 
 		 612 aa  81.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  22.67 
 
 		 606 aa  81.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1830  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  21.14 
 
 		 589 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  23.89 
 
 		 596 aa  80.5  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  22.51 
 
 		 596 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  23.04 
 
 		 609 aa  80.5  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  20.57 
 
 		 583 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  19.3 
 
 		 646 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  20.73 
 
 		 968 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  20.14 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3308  ABC transporter related  20.6 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.682367  hitchhiker  0.0000512121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  26.22 
 
 		 603 aa  79.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  19.75 
 
 		 586 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  22.14 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.15 
 
 		 1006 aa  79  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.22 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  20.91 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  22.4 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  20.13 
 
 		 586 aa  78.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8076  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  23.98 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0419545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.07 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  22.96 
 
 		 637 aa  77.8  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  20.79 
 
 		 610 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  19.9 
 
 		 586 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  21.48 
 
 		 613 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.17 
 
 		 1257 aa  77  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  19.26 
 
 		 617 aa  77  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  22.42 
 
 		 575 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0741  ABC transporter related protein  21.15 
 
 		 650 aa  77.4  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1432  ABC transporter related protein  22.91 
 
 		 661 aa  77.4  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.590543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  21.77 
 
 		 632 aa  77.4  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  21.45 
 
 		 577 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  24.64 
 
 		 577 aa  77  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0955  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  22.34 
 
 		 644 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  22.77 
 
 		 1003 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  24.44 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.28 
 
 		 721 aa  76.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  23.04 
 
 		 578 aa  76.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  23.77 
 
 		 641 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  20.54 
 
 		 610 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1057  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  22.34 
 
 		 644 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.681718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  21.7 
 
 		 605 aa  77  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09251  multidrug ABC transporter  26.97 
 
 		 583 aa  76.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.532954  normal  0.0147253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>