More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1251 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  79.09 
 
 		 295 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  77.74 
 
 		 295 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  71.03 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  53.38 
 
 		 290 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  52.26 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  55.63 
 
 		 288 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  55.12 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  53.52 
 
 		 284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  53.02 
 
 		 285 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  55.48 
 
 		 288 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  53.57 
 
 		 287 aa  305  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  54.32 
 
 		 284 aa  305  9.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  51.99 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  50.71 
 
 		 290 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  54.32 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  53.96 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  53.6 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  53.57 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  47.52 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  45.55 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  46.21 
 
 		 281 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  30.24 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  30.93 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0286  branched-chain amino acid aminotransferase  33.83 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0618931  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  29.9 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  29.79 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  33.57 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  33.57 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  29.55 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  31.8 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 		 309 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  31.96 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 303 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  32.51 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  31.88 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4013  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0147074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.68 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  32.04 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  33.8 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  32.31 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  32.75 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  29.29 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  31.82 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  32.04 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  32.39 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  31.1 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  31.1 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  31.1 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  30.58 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  29.39 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  29.32 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  28.42 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  31.79 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  29.24 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  30.03 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  30.14 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  30.27 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  29.58 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.24 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1464  aminotransferase, class IV  31.97 
 
 		 305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>