68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2936 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2936  phycobilisome linker polypeptide  100 
 
 		 279 aa  568  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.993675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3483  phycobilisome linker polypeptide  80.43 
 
 		 276 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2937  phycobilisome linker polypeptide  56.72 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3482  phycobilisome linker polypeptide  53.54 
 
 		 247 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2939  phycobilisome linker polypeptide  50.63 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3481  phycobilisome linker polypeptide  49.8 
 
 		 253 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.705659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3909  phycobilisome linker polypeptide  56.38 
 
 		 252 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2938  phycobilisome linker polypeptide  54 
 
 		 237 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1699  Phycobilisome linker polypeptide  52.33 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0349774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1700  Phycobilisome linker polypeptide  51.58 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.522375  normal  0.0382832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3508  Phycobilisome linker polypeptide  52.66 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2030  phycobilisome rod-core linker polypeptide  50.53 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1383  Phycobilisome linker polypeptide  51.06 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1353  Phycobilisome linker polypeptide  51.06 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2486  phycobilisome linker polypeptide  50.61 
 
 		 236 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2287  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG (L-RC 28.5)  39.83 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0399  phycobilisome rod-core linker polypeptide cpcG  36.71 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0446  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  46.11 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.237033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1881  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  44.04 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2579  phycobilisome rod-core linker polypeptide (L-RC 28.5)  41.62 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.71401  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4529  Phycobilisome linker polypeptide  38.62 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0956288  normal  0.913369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2210  phycobilisome linker polypeptide  40 
 
 		 913 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0971092 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5725  Phycobilisome linker polypeptide  37.93 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1049  phycobilisome rod linker polypeptide  35.33 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1050  phycobilisome rod linker polypeptide  36.31 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2620  phycobilisome protein  39.46 
 
 		 1132 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00272718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1003  phycobilisome rod-core linker polypeptide  37.89 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.524951  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0443  phycobilisome linker polypeptide  40.8 
 
 		 549 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0999  phycobilisome linker polypeptide  40.98 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3043  Phycobilisome linker polypeptide  41.8 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3077  Phycobilisome linker polypeptide  41.8 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2632  Phycobilisome linker polypeptide  38.24 
 
 		 898 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.650102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2095  Phycobilisome linker polypeptide  37.84 
 
 		 903 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780975  normal  0.55469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2071  Phycobilisome linker polypeptide  37.84 
 
 		 903 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0158  Phycobilisome linker polypeptide  41.8 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0115125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2430  phycobilisome linker polypeptide  35.37 
 
 		 1130 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1695  Phycobilisome linker polypeptide  39.23 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0159  Phycobilisome linker polypeptide  37.09 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1884  phycobilisome linker polypeptide  41.41 
 
 		 546 aa  95.5  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.339596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5149  Phycobilisome linker polypeptide  37.5 
 
 		 1100 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03401  hypothetical protein  38.4 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1883  phycobilisome linker polypeptide  33.12 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1895  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  38.73 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4528  Phycobilisome linker polypeptide  39.17 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.716968 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5724  Phycobilisome linker polypeptide  39.06 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4104  phycobilisome linker polypeptide  34.06 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0150597  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2209  phycobilisome linker polypeptide  32.91 
 
 		 702 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1871  phycobilisome linker polypeptide  40.62 
 
 		 300 aa  89.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  34.59 
 
 		 705 aa  89  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3487  phycobilisome linker polypeptide  37.19 
 
 		 286 aa  89  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.321477  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3076  Phycobilisome linker polypeptide  36.29 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1694  Phycobilisome linker polypeptide  36.89 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.311002 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0480  anchor polypeptide LCM  34.12 
 
 		 972 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1534  phycobilisome linker polypeptide  36.88 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3044  Phycobilisome linker polypeptide  35.48 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0985  phycobilisome linker polypeptide  34.72 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242776  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2932  CpcD phycobilisome linker-like  34.29 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03921  hypothetical protein  35.37 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.268677  normal  0.0756841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0444  hypothetical protein  36.92 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.072834  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2196  anchor polypeptide LCM  35.14 
 
 		 983 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0433  C-phycoerythrin class II gamma chain, linker polypeptide  38.89 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0444  phycobilisome linker polypeptide  31.21 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.252895 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0295  phycobilisome linker polypeptide  39.02 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2927  CpcD phycobilisome linker-like  39.34 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1678  phycoerythrin class III gamma chain  36.8 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.0080069  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1885  phycobilisome linker polypeptide  29.55 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.154256  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0442  phycobilisome linker polypeptide  31.11 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.279269  normal  0.13238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4105  phycobilisome linker polypeptide  33.05 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0449765  normal  0.555714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>