More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0705 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 182 aa  360  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  91.23 
 
 		 182 aa  312  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  77.53 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  70.22 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  70.22 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  70.22 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  67.42 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  66.85 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  65.73 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  62.92 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  65 
 
 		 181 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  62.92 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  64.61 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  58.43 
 
 		 178 aa  214  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  59.44 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 		 178 aa  211  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  58.33 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  58.66 
 
 		 180 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  58.95 
 
 		 191 aa  207  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 182 aa  207  6e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56.91 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  55.62 
 
 		 178 aa  205  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  57.3 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  56.18 
 
 		 180 aa  204  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  56.73 
 
 		 183 aa  204  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  56.67 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 178 aa  201  7e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 178 aa  200  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  56.11 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  54.84 
 
 		 187 aa  198  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  58.89 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  58.29 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  54.86 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  57.22 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  56.11 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  55.87 
 
 		 179 aa  194  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 178 aa  194  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  55 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  191  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  53.07 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  54.97 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  53.23 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>