148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0019 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0019  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 297 bp  589  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000680683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0080    90.07 
 
 		 295 bp  153  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00404274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0068  RNA component of RNaseP  89.17 
 
 		 372 bp  135  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.415959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0018    88.24 
 
 		 358 bp  135  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000656254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0043    83.33 
 
 		 303 bp  135  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.15761  hitchhiker  0.00179895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0043  RNA component of RNaseP  96.05 
 
 		 213 bp  127  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000487494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0017  RNA component of RNaseP  86.82 
 
 		 303 bp  121  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0120396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0035  RNA component of RNaseP  92.31 
 
 		 363 bp  107  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.531572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0015  RNA component of RNaseP  91.03 
 
 		 313 bp  99.6  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0681345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0067  RNA component of RNaseP  85.04 
 
 		 398 bp  93.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.742746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0037  RNA component of RNaseP  95.74 
 
 		 323 bp  77.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.0345695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0081  RNA component of RNaseP  85.71 
 
 		 327 bp  77.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000487507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_DernpB1  sRNA  87.18 
 
 		 261 bp  75.8  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.573184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0017  RNA component of RNaseP  87.18 
 
 		 307 bp  75.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0316864  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0006  RNAse P  87.18 
 
 		 304 bp  75.8  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.161973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0048  RNA component of RNaseP  93.88 
 
 		 298 bp  73.8  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0097  RNA component of RNaseP  86.08 
 
 		 346 bp  69.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0013  RNA component of RNaseP  84.44 
 
 		 296 bp  67.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.297268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0030  RNA component of RNaseP  93.33 
 
 		 309 bp  65.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0736  Bacterial RNase P class A  100 
 
 		 288 bp  65.9  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0033  RNA component of RNaseP  97.3 
 
 		 332 bp  65.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GsrnpB1  sRNA  85.53 
 
 		 315 bp  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0039  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 328 bp  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.652207 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0033  RNA component of RNaseP  97.22 
 
 		 272 bp  63.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0003  RNA component of RNaseP  85.53 
 
 		 315 bp  63.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0059    97.14 
 
 		 330 bp  61.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0053  RnaseP RNA  85.33 
 
 		 302 bp  61.9  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651902  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0034  RNA component of RNaseP  97.14 
 
 		 284 bp  61.9  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  97.06 
 
 		 342 bp  60  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0012  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 356 bp  58  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0591334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0003  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 327 bp  58  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0073  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 299 bp  58  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0036  rnpB RNA  91.11 
 
 		 337 bp  58  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0030  RNA component of RNaseP  94.59 
 
 		 369 bp  58  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.541777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  94.59 
 
 		 354 bp  58  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0053  RNase P  96.97 
 
 		 326 bp  58  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0012  RNA component of RNaseP  96.97 
 
 		 357 bp  58  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0056  RNase P class A  94.59 
 
 		 276 bp  58  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.441573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0041  RNA component of RNaseP  92.68 
 
 		 329 bp  58  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0042  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 332 bp  56  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.522525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_McrnpB1  sRNA  96.88 
 
 		 359 bp  56  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0005  RNA component of RNaseP  92.5 
 
 		 381 bp  56  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.328274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  82.95 
 
 		 285 bp  56  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0014  RNaseP RNA  96.88 
 
 		 296 bp  56  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0076  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 303 bp  56  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0051  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 328 bp  56  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0032  RNA component of RNaseP  94.44 
 
 		 326 bp  56  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 373 bp  56  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0020    96.88 
 
 		 296 bp  56  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0020    96.88 
 
 		 296 bp  56  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0029  RNA component of RNaseP  92.5 
 
 		 298 bp  56  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.538332  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0013  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 303 bp  56  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0021  RNA component of RNaseP  90.7 
 
 		 328 bp  54  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.584504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0003  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 305 bp  54  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 301 bp  54  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1797  bacterial RNase P, class A  96.77 
 
 		 380 bp  54  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.848087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0038  RNA component of RNaseP  96.77 
 
 		 348 bp  54  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000786849  hitchhiker  0.000162331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1257  hypothetical protein  92.31 
 
 		 369 bp  54  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000363203  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WprnpB1  WprnpB1  94.12 
 
 		 292 bp  52  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5661  RNaseP_bact_a  96.67 
 
 		 293 bp  52  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00231772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA62  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 292 bp  52  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0016  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 329 bp  52  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0014  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 331 bp  52  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000221757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  89.13 
 
 		 301 bp  52  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0126    96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0007  bacterial RNase P  96.67 
 
 		 294 bp  52  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0088  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 295 bp  52  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.338139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0134  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0146  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 299 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  89.13 
 
 		 308 bp  52  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0025  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 298 bp  52  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55190  RNase P RNA component precursor RnpB  96.67 
 
 		 296 bp  52  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0092  RNA component of RNaseP  96.67 
 
 		 295 bp  52  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0011    96.67 
 
 		 295 bp  52  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpps01    96.55 
 
 		 205 bp  50.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpls01    96.55 
 
 		 205 bp  50.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0003  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 283 bp  50.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000142891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0049  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 386 bp  50.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.653302  normal  0.250597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R74  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 291 bp  50.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499712 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0003  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.158613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0022  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00496302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0972  sRNA  93.94 
 
 		 292 bp  50.1  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 355 bp  50.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0004  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 281 bp  50.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000603454  normal  0.0636822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0217  Bacterial RNase P class A  93.94 
 
 		 294 bp  50.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235788  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0029  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 318 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223186  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0216  sRNA  93.94 
 
 		 346 bp  50.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0026  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0054  rnpB RNA  96.55 
 
 		 298 bp  50.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0026    91.89 
 
 		 352 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112787  normal  0.29331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 356 bp  50.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0037  RNA component of RNaseP  90.24 
 
 		 316 bp  50.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353457  normal  0.717532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0030  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 322 bp  50.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0033  RNA component of RNaseP  88.89 
 
 		 348 bp  50.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0667281  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  91.89 
 
 		 353 bp  50.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0023    93.94 
 
 		 341 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0216677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0085  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 358 bp  50.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162846  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    93.94 
 
 		 344 bp  50.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0068  RNA component of RNaseP  90 
 
 		 350 bp  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000826287  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0061  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 418 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0246154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>