More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0705 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
255 aa  522  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 
257 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  33.86 
 
 
254 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.6 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  34.41 
 
 
267 aa  138  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.27 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  31.75 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  31.75 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.11 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
253 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.27 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  32.95 
 
 
276 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
260 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 
253 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  34.38 
 
 
259 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
253 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
253 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 
253 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
274 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1675  DeoR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00609311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
262 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.14 
 
 
260 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0907  DeoR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
274 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  28.69 
 
 
246 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
254 aa  115  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  30.38 
 
 
260 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 
253 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.28 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
254 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
376 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.89 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  27.89 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  27.89 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.89 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  28.93 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  28.76 
 
 
254 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  28.29 
 
 
246 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.29 
 
 
269 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
254 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  28.88 
 
 
257 aa  111  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  31.17 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2986  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.49 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0119  transcriptional regulator, DeoR family  31.87 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.66 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  29.34 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  29.91 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
261 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  29.2 
 
 
261 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5218  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.439257 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0103  HTH-type transcriptional regulator, DeoR-family  31.62 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>