More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4431 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
128 aa  259  8e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  76.32 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  76.32 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  76.32 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  71.19 
 
 
136 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  80.58 
 
 
129 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  78.85 
 
 
127 aa  165  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  64.57 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  70.43 
 
 
135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  75.73 
 
 
134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  73.28 
 
 
129 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  73.28 
 
 
129 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  67.27 
 
 
118 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  67.27 
 
 
118 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  67.96 
 
 
120 aa  146  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  71.31 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  61.61 
 
 
117 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  65.71 
 
 
130 aa  137  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  64.08 
 
 
119 aa  137  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  63.3 
 
 
113 aa  136  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  60.17 
 
 
126 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  73.53 
 
 
143 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  68.82 
 
 
127 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  68.82 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  73.39 
 
 
125 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  73.39 
 
 
125 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  73.39 
 
 
145 aa  130  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  62.14 
 
 
117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  65.05 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  59.29 
 
 
121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5055  transcriptional regulator, ArsR family  64.21 
 
 
124 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0470  transcriptional regulator, ArsR family  59.79 
 
 
134 aa  100  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3634  regulatory protein, ArsR  66.67 
 
 
94 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14670  transcriptional regulator, ArsR family  52 
 
 
132 aa  97.8  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.475992  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4577  regulatory protein ArsR  56.25 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  38.14 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  48.51 
 
 
121 aa  86.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36.94 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  34 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  33 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  41.41 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 
115 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
108 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  37.8 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  40 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  30.77 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5679  putative transcriptional regulator  55.17 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455024 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5331  putative transcriptional regulator  55.17 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0697124  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  44.78 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  44.05 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  38.55 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  35.87 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07760  predicted transcriptional regulator  35.92 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.853788  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  38.55 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0349  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  45.59 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1533  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188631  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2621  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
107 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136975  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  39.13 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
103 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4445  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  48.57 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  36.67 
 
 
105 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  46.84 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  34.09 
 
 
102 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
98 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  37.66 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1063  transcriptional regulator, ArsR family  43.24 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371021  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  36.96 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2208  putative transcriptional regulator  47.3 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2069  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  42.05 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>