More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4356 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  56.6 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  49.21 
 
 		 258 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.2 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.4 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  54.09 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.8 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.79 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.43 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.64 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.6 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  51.03 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 278 aa  242  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  50 
 
 		 253 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.69 
 
 		 280 aa  239  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  54.85 
 
 		 263 aa  239  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  44.31 
 
 		 279 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.24 
 
 		 261 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51.09 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.58 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50.43 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  51.54 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  51.01 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  48.19 
 
 		 259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  49.36 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  51.26 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.32 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.43 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  46.8 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.18 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  46.99 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.75 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  46.83 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  51.28 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.56 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.18 
 
 		 292 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.51 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  45.64 
 
 		 284 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  48.05 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  51.29 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.3 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.8 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.76 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.4 
 
 		 267 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.21 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.24 
 
 		 259 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.2 
 
 		 271 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.64 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.67 
 
 		 288 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 260 aa  224  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  46.84 
 
 		 269 aa  224  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.18 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  45.06 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  47.66 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.41 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.99 
 
 		 261 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  50 
 
 		 263 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  45.19 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.08 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  47.72 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  45.06 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  46.69 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.72 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  44.4 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  47.06 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  50.7 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  44.4 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  47.06 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  47.79 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  43.82 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.21 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.18 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.79 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.36 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  40.07 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.7 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.53 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  43.03 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.21 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.81 
 
 		 263 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 		 281 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.89 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  44.35 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  47.58 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  47.06 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 265 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>