More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2478 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  100 
 
 
225 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  76.44 
 
 
225 aa  345  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  44.34 
 
 
291 aa  188  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  43.24 
 
 
291 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  50.27 
 
 
219 aa  172  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  41.78 
 
 
360 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  44.56 
 
 
269 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  44.74 
 
 
289 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  36.91 
 
 
338 aa  158  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  44.44 
 
 
247 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  44.22 
 
 
284 aa  154  8e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  38.96 
 
 
213 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  39.9 
 
 
247 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  44.88 
 
 
267 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  45.45 
 
 
251 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  44.16 
 
 
199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  37.44 
 
 
268 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  37.99 
 
 
290 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  39.07 
 
 
213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  39.25 
 
 
279 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10030  signal peptidase I  46.07 
 
 
192 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.328546  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  38.57 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  39.15 
 
 
311 aa  138  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  39.17 
 
 
304 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  45.05 
 
 
243 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  38.01 
 
 
289 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  42.13 
 
 
434 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  39.52 
 
 
209 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  42.36 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  37.39 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  42.78 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  39.79 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  34.86 
 
 
469 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  36.06 
 
 
266 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  36.45 
 
 
304 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  40 
 
 
352 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  35.11 
 
 
288 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  33.91 
 
 
272 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  32.14 
 
 
341 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  34.58 
 
 
299 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  36.67 
 
 
216 aa  109  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  35.55 
 
 
285 aa  101  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  33.33 
 
 
298 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  36.28 
 
 
262 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  33.06 
 
 
261 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  33.18 
 
 
267 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  34.08 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  32.08 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  33.91 
 
 
294 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  34.48 
 
 
173 aa  93.2  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1202  signal peptidase I  28.84 
 
 
186 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000715638  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  33.33 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  31.43 
 
 
284 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.29 
 
 
185 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  31.84 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  32.2 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.25 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  29.77 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1094  signal peptidase I  31.34 
 
 
183 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000597115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  32.48 
 
 
286 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  32.37 
 
 
197 aa  88.6  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  31.3 
 
 
284 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  31.3 
 
 
284 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  31.3 
 
 
284 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1306  signal peptidase I S  31.03 
 
 
183 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168305  unclonable  9.670830000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  31.36 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3937  signal peptidase I S  31.03 
 
 
183 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000205751  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  28.64 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3852  signal peptidase I S  31.19 
 
 
183 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.78284e-62 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  32.8 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3881  signal peptidase I S  31.19 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000109164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3690  signal peptidase I S  31.19 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000137808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3580  signal peptidase I S  31.19 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.71528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3662  signal peptidase I  30.69 
 
 
183 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3598  signal peptidase I S  31.19 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000018281  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3977  signal peptidase I S  31.19 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000843557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2491  signal peptidase I  31.16 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000161769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3886  signal peptidase I S  31.19 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000194308  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  30.15 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  30.15 
 
 
200 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  28.18 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  33.16 
 
 
197 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  31.34 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  35.71 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  28.42 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  28.5 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1987  signal peptidase I  28.3 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0388  signal peptidase I  27.05 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.932746  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  28.23 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  30.77 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  28.21 
 
 
173 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  33.16 
 
 
174 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1191  signal peptidase I  28.64 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0549747  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  32.11 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  28.21 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  30.2 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4150  signal peptidase I  28.14 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.432313  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  30.46 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1039  signal peptidase I  28.24 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.260749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1243  signal peptidase I  28.17 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>