More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1795 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
271 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2270  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 
269 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.39 
 
 
254 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1625  IclR-type transcriptional regulator  31.94 
 
 
277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 
250 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
250 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
250 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 
250 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  32.59 
 
 
269 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 
250 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
263 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 
266 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 
266 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
249 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
267 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 
249 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
265 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
249 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
249 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
269 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
262 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 
259 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
260 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 
252 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
246 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
249 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
254 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.63 
 
 
246 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
269 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  30.9 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 
260 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  30.47 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  27.31 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.65 
 
 
256 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0492  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
302 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1796  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.93 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
249 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 
265 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
260 aa  92  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0043  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.31 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.1 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  24.28 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  31.72 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.85 
 
 
278 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 
260 aa  89  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1626  IclR-type transcriptional regulator  33.04 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  24.58 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  30.91 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
252 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
294 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 
255 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
268 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  29.26 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.99 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19700  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.089385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 
257 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.05 
 
 
569 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.75 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.75 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1602  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.75 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>