64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0041 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  48.81 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  41.02 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  41.02 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  41.02 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  41.75 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  35.33 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  38.05 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  39.86 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  30.98 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  30.97 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  30.74 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  29.93 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  29.97 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  29.39 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  29.67 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  28.47 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  35.71 
 
 		 147 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  27.7 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.08 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  27.91 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  29.32 
 
 		 149 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.17 
 
 		 187 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2179  universal stress protein  30.2 
 
 		 146 aa  49.3  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  30.53 
 
 		 154 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1666  hypothetical protein  38.71 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.448158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1387  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316543  normal  0.887098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  25.75 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 156 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4254  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 169 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.462473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  28.67 
 
 		 156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 156 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  28.08 
 
 		 308 aa  45.8  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  33.6 
 
 		 168 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  25.17 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  40.91 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.21 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.07 
 
 		 141 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.61 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 		 147 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  29.27 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  37.04 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  26.05 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  26.05 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  26.83 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  25.33 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  35 
 
 		 141 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 138 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  23.74 
 
 		 140 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  27.36 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  25 
 
 		 150 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 143 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.39 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1650  universal stress protein  29.45 
 
 		 156 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.262714  normal  0.111079 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  22.28 
 
 		 415 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>