70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1022 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 75 aa  148  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 205 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2292  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.183248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 497 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3680  helix-turn-helix domain protein  37.1 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 77 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  35.85 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  34.38 
 
 		 472 aa  42.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 81 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 70 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 72 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 81 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 85 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  39.62 
 
 		 227 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 81 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1180  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.133666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 490 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  32.26 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 179 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 312 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  26.98 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1324  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  41.07 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 80 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  36.21 
 
 		 461 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 461 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  36.21 
 
 		 461 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4630  transcriptional regulator, PbsX family  35.38 
 
 		 94 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  32.26 
 
 		 69 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>