71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3873 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  100 
 
 
208 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  79.05 
 
 
210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  83.87 
 
 
209 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 
184 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  37.43 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  37.43 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  36.9 
 
 
238 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  37.25 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
187 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  28.16 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  31.87 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
211 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  32.5 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  31.03 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  31.75 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
214 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
213 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
209 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
224 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
246 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  32.81 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  42 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>