More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3664 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3664  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  577  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.23675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1094  transcriptional regulator, LysR family  76.69 
 
 		 301 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1034  LysR family transcriptional regulator  76.35 
 
 		 301 aa  417  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1082  transcriptional regulator, LysR family  76.61 
 
 		 300 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.722642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  32.98 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26300  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4256  DNA-binding transcriptional activator XapR  31.83 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  34.52 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4410  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 303 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.72 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.54 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 294 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.3 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0828  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2679  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6844  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4632  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40910  LysR family transcriptional regulatory protein  32.36 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  30.61 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1334  LysR substrate-binding  25 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.622556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3010  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  32 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  28.08 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5426  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.954201 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  34.56 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  33.2 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  33.2 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  34.56 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>