More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0774 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  88.43 
 
 
437 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  100 
 
 
444 aa  876    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  88.66 
 
 
437 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  88.19 
 
 
437 aa  711    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  59.45 
 
 
463 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  59.54 
 
 
441 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  58.81 
 
 
435 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  57.67 
 
 
434 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  57.67 
 
 
434 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  57.18 
 
 
432 aa  482  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  56.21 
 
 
440 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  57.76 
 
 
435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  53.01 
 
 
443 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  56.91 
 
 
459 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  52.05 
 
 
457 aa  450  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  51.14 
 
 
457 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  55.85 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.66 
 
 
457 aa  440  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  52.8 
 
 
447 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  53.33 
 
 
447 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  53.13 
 
 
441 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  53.9 
 
 
458 aa  430  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  52.02 
 
 
439 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 
446 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  49.08 
 
 
445 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.97 
 
 
450 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  54.68 
 
 
485 aa  417  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  49.54 
 
 
447 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.06 
 
 
731 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  49.28 
 
 
426 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 
447 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.31 
 
 
726 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  52.73 
 
 
447 aa  408  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  48.6 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.5 
 
 
739 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  49.32 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  53.35 
 
 
505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  47.62 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  49.04 
 
 
420 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  52.26 
 
 
449 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  48.17 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  47.14 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1287  recombination factor protein RarA  51.18 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  53.24 
 
 
459 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  51.32 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  50 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  50.89 
 
 
434 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  45.54 
 
 
425 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  55 
 
 
427 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 
438 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  50.48 
 
 
444 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  52.37 
 
 
435 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.29 
 
 
444 aa  391  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.76 
 
 
457 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0766  recombination factor protein RarA  47.34 
 
 
453 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0590013  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.29 
 
 
735 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1128  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 
440 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 
461 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  45.31 
 
 
441 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
447 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2595  recombination factor protein RarA  49.17 
 
 
446 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5733  AAA ATPase central domain protein  47.97 
 
 
423 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855875  normal  0.0926038 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 
440 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3176  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
435 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2713  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 
442 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  53.63 
 
 
429 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  46.93 
 
 
423 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  45.89 
 
 
431 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 
440 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3365  recombination factor protein RarA  50 
 
 
442 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.263258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  51.04 
 
 
437 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2120  recombination factor protein RarA  50 
 
 
455 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1519  recombination factor protein RarA  51.64 
 
 
447 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.615755  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3074  recombination factor protein RarA  50 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0319141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.88 
 
 
733 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.44 
 
 
721 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1563  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
436 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3797  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
427 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0736  AAA ATPase central domain-containing protein  50.84 
 
 
432 aa  384  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.776612  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3040  recombination factor protein RarA  50 
 
 
436 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2988  recombination factor protein RarA  50 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0792  recombination factor protein RarA  50 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.18 
 
 
734 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2624  recombination factor protein RarA  50 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1122  recombination factor protein RarA  51.55 
 
 
443 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0552039  normal  0.120002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3209  recombination factor protein RarA  48.46 
 
 
432 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411759  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1988  recombination factor protein RarA  50 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  54.5 
 
 
436 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.71 
 
 
734 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  50.81 
 
 
441 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  52.28 
 
 
451 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  50.83 
 
 
461 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 
451 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  49.06 
 
 
443 aa  381  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1664  recombination factor protein RarA  46.88 
 
 
442 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0526535  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3636  recombination factor protein RarA  47.49 
 
 
443 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  47.27 
 
 
444 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0694  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 
445 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>