257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0573 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 352 aa  731    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  35.73 
 
 		 382 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  32.85 
 
 		 375 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  33.75 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  32.46 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  32.48 
 
 		 409 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  32.4 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  30.94 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  30.94 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  31.59 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  29.86 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  36.73 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  36.73 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  36.73 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  34 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  34.22 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  36.73 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  31.45 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  33.74 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  27.97 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  27.37 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  27.86 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  28.21 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2915  ribonuclease D  28.22 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.71174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  32.51 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3141  ribonuclease D  28.22 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.579669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1994  ribonuclease D  28.2 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.045905  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  33.47 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  30.64 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  28.77 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  30.47 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  30.61 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  33.91 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  32.4 
 
 		 407 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  29.67 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1392  3'-5' exonuclease  33.47 
 
 		 406 aa  109  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.125783  normal  0.298063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  28.74 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1937  ribonuclease D  28.02 
 
 		 374 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  28.08 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  30.61 
 
 		 379 aa  109  8.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  29.79 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  27.63 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  30.9 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  30.3 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  30.77 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  26.85 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2232  ribonuclease D  27.91 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000142967  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  31.84 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0506  ribonuclease D  27.95 
 
 		 395 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  27.41 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  27.41 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  31.23 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  30.71 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  30.77 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  30.09 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3068  ribonuclease D  28.41 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.439907  normal  0.252562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  32.08 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1971  ribonuclease D  28.22 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  32.4 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0679  ribonuclease D  28.22 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  32.4 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  31.06 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  30.21 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  32.4 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  29.54 
 
 		 451 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  32.17 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  27.27 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  32 
 
 		 375 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0690  ribonuclease D  31.4 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00562045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2016  ribonuclease D  32 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00169692  normal  0.221518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  32.41 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  31.39 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  32.99 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  30.92 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  31.2 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  30.08 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  31.2 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2009  ribonuclease D  28.7 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  31.2 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  30.8 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  31.2 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  31.2 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2542  ribonuclease D  26.24 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1474  ribonuclease D  28.14 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.366853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  32.03 
 
 		 384 aa  99.8  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1838  ribonuclease D  26.92 
 
 		 386 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.529278  normal  0.0732716 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2064  ribonuclease D  30.8 
 
 		 375 aa  99.8  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  27.52 
 
 		 381 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  30.8 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  30.8 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2013  ribonuclease D  32.62 
 
 		 373 aa  99.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000328628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2124  ribonuclease D  32.62 
 
 		 373 aa  99.4  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0137564  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2402  ribonuclease D  32.62 
 
 		 373 aa  99.4  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  29.12 
 
 		 451 aa  99.4  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  30.8 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  25.41 
 
 		 392 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  32.63 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  27.47 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  31.49 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  32.63 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>