More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6801 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  52.4 
 
 		 274 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  50.18 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  50.21 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  50.64 
 
 		 279 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  52.94 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  47.5 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  42.55 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  48.95 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  46.06 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  49.19 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  50.92 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  48.67 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  41.91 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  41.22 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  42.03 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  43.27 
 
 		 323 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  42.28 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  41.22 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  40.38 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  41.43 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  39.93 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  44.58 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  41.3 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  42.34 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  42.15 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  36.21 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  42.8 
 
 		 304 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  41.74 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  39.13 
 
 		 281 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  37.8 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  32.37 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  34.84 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  35.51 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.39 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  34.27 
 
 		 341 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  30.22 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.45 
 
 		 751 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.5 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  37.89 
 
 		 328 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.8 
 
 		 276 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.8 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.07 
 
 		 276 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  33.33 
 
 		 328 aa  113  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.94 
 
 		 324 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  32.13 
 
 		 340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.78 
 
 		 600 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.79 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.48 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  27.72 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  30.24 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.42 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  32.44 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  32.97 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  30.35 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.16 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  30.65 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  32.16 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.85 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.12 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 		 276 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.53 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.71 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.71 
 
 		 259 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  30.41 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  30.57 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  29.28 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>