More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4236 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
535 aa  1070    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.06 
 
 
545 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.81 
 
 
543 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.44 
 
 
543 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.44 
 
 
543 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.45 
 
 
562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.9 
 
 
568 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.61 
 
 
552 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.13 
 
 
624 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.08 
 
 
546 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1009  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.91 
 
 
571 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.752624 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.98 
 
 
563 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.74 
 
 
590 aa  329  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.22 
 
 
557 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.09 
 
 
716 aa  316  7e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 
630 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.38 
 
 
556 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.97 
 
 
705 aa  310  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.96 
 
 
588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.04 
 
 
602 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.42 
 
 
598 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.48 
 
 
646 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.13 
 
 
1376 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.53 
 
 
515 aa  300  6e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.81 
 
 
509 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.61 
 
 
509 aa  299  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  34.41 
 
 
509 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.58 
 
 
793 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.61 
 
 
607 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.25 
 
 
626 aa  296  9e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.41 
 
 
509 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.21 
 
 
509 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.21 
 
 
509 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34 
 
 
509 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.38 
 
 
509 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 
509 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.75 
 
 
584 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.1 
 
 
748 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.77 
 
 
615 aa  286  5e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.55 
 
 
614 aa  286  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  36.61 
 
 
609 aa  286  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  36.61 
 
 
611 aa  286  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.4 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 
609 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 
609 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 
611 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.39 
 
 
615 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 
609 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.05 
 
 
594 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 
609 aa  283  5.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 
607 aa  283  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.39 
 
 
615 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 
609 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.82 
 
 
711 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.19 
 
 
599 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.46 
 
 
608 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.17 
 
 
615 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.12 
 
 
725 aa  281  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.93 
 
 
708 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.17 
 
 
615 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.17 
 
 
615 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.44 
 
 
728 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.19 
 
 
709 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.19 
 
 
709 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
737 aa  279  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.6 
 
 
602 aa  279  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.01 
 
 
503 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.03 
 
 
608 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
607 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.25 
 
 
602 aa  277  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.83 
 
 
729 aa  276  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.06 
 
 
712 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
607 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.24 
 
 
705 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0281  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.97 
 
 
731 aa  276  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 
607 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.6 
 
 
590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.52 
 
 
736 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
607 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.69 
 
 
724 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  38.8 
 
 
724 aa  274  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 
607 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.34 
 
 
616 aa  274  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 
607 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.19 
 
 
620 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.15 
 
 
617 aa  273  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.89 
 
 
497 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 
607 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 
647 aa  273  6e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.99 
 
 
607 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.86 
 
 
707 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  34.81 
 
 
493 aa  272  9e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 
615 aa  272  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 
597 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 
610 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
729 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 
610 aa  272  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.36 
 
 
721 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.23 
 
 
488 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>