189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3313 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
181 aa  359  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  67.55 
 
 
188 aa  249  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  67.03 
 
 
188 aa  247  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  60.56 
 
 
183 aa  207  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  64.52 
 
 
167 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  40 
 
 
177 aa  144  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  40.44 
 
 
182 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  43.41 
 
 
182 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
182 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.86 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.32 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  42.46 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  39.04 
 
 
185 aa  127  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.87 
 
 
183 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  41.85 
 
 
186 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.52 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  39.13 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.84 
 
 
181 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.95 
 
 
178 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.4 
 
 
181 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.65 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.21 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  36.46 
 
 
199 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.24 
 
 
204 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  37.67 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.55 
 
 
189 aa  91.3  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  38.61 
 
 
215 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.22 
 
 
180 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.39 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.48 
 
 
185 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  37.67 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.34 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.24 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.32 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.7 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  41.78 
 
 
151 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.71 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
199 aa  82  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  37.68 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.2 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.57 
 
 
192 aa  80.9  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.65 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.21 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  35.2 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.33 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  35.03 
 
 
204 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.71 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.78 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  34.05 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  28.95 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.44 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.23 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.77 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  34.25 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.08 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.76 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  33.87 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.57 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  34.42 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.49 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.93 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.93 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  31.53 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.56 
 
 
224 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.59 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.45 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.03 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.97 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.54 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.84 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.96 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.93 
 
 
193 aa  61.6  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.55 
 
 
197 aa  60.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.73 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>