More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3276 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  100 
 
 		 407 aa  816    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  63 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  63.13 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  58.33 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  51.51 
 
 		 405 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  47.89 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  47.64 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  48.07 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  48.07 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  47.83 
 
 		 412 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  46.75 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  46.75 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  46.75 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  44.9 
 
 		 416 aa  323  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  44.58 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  44.96 
 
 		 400 aa  322  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  44.15 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  42.62 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  45.23 
 
 		 398 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  43.86 
 
 		 404 aa  312  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  46.72 
 
 		 395 aa  305  7e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  42.09 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  42.82 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  42.79 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  43.53 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  41.65 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  43.37 
 
 		 430 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  41.56 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  41.16 
 
 		 400 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.31 
 
 		 409 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  40.91 
 
 		 400 aa  279  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  43 
 
 		 404 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  42.13 
 
 		 401 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  41.84 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  41.36 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  42.14 
 
 		 415 aa  277  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  41.09 
 
 		 400 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  40.69 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  41.38 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  42.32 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  40.45 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  40.45 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  40.24 
 
 		 407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  39.36 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  40 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  43.09 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.33 
 
 		 421 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  40.3 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  39.36 
 
 		 402 aa  265  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  41.03 
 
 		 406 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  40.49 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  39.85 
 
 		 408 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  43.09 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  39.17 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  39.17 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  39.17 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.46 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  39.65 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  41.09 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  36.82 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  39.85 
 
 		 400 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  42.03 
 
 		 345 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  37.28 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  37.25 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  41.05 
 
 		 375 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.02 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  38.81 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.69 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.55 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.46 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.02 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  38.24 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  35.73 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  36.07 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  36.08 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  34.98 
 
 		 391 aa  209  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.39 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.18 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  36.88 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  36.25 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.14 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  37.11 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.94 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.12 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.34 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.79 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.87 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.95 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.51 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.13 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  35.18 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  38.3 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  32.45 
 
 		 425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.26 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.15 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.92 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.7 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.6 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.97 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.78 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>