More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3075 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  100 
 
 		 437 aa  846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  43.71 
 
 		 442 aa  308  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  43.02 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  41.18 
 
 		 444 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  45.74 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  42.56 
 
 		 444 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  44.44 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  44.21 
 
 		 451 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  43.97 
 
 		 450 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  44.75 
 
 		 442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  43.58 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  41.71 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  43.18 
 
 		 442 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  42.89 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  41.22 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  42.18 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  40.97 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  40.69 
 
 		 444 aa  279  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  40.74 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  40.74 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  42.5 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  41.67 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  40.46 
 
 		 444 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  41.12 
 
 		 440 aa  276  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  40.51 
 
 		 444 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  40.46 
 
 		 444 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  42.05 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  41.04 
 
 		 442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  42.96 
 
 		 443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  40.97 
 
 		 442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  42.62 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  41.72 
 
 		 447 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  41.15 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  41.15 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  41.15 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  41.15 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  41.15 
 
 		 448 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  41.15 
 
 		 448 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  41.15 
 
 		 448 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  41.03 
 
 		 446 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  34.73 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  40.32 
 
 		 446 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  41.51 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2328  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000223994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2139  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2077  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2073  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2294  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2319  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2402  hypothetical protein  34.82 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  36.41 
 
 		 455 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3048  hypothetical protein  34.35 
 
 		 436 aa  253  6e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2275  hypothetical protein  34.35 
 
 		 436 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2112  hypothetical protein  34.91 
 
 		 436 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.68 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  39.11 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1682  hypothetical protein  33.65 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  38 
 
 		 454 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  36.38 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  41.55 
 
 		 444 aa  242  7.999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  37.29 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  36.75 
 
 		 449 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  37.76 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  35.73 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  36.05 
 
 		 447 aa  233  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4421  hypothetical protein  35.19 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  38 
 
 		 446 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  39.42 
 
 		 449 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  39.17 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  39.17 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  39.17 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  39.17 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  39.17 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  39.17 
 
 		 449 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  38.24 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  34.55 
 
 		 467 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  38.93 
 
 		 449 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  38 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  37.8 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  35.89 
 
 		 456 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  35.31 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  38.12 
 
 		 478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  36.64 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2285  hypothetical protein  33.64 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19249  hitchhiker  0.00838823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  35.35 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1338  aminotransferase class-III  34.99 
 
 		 479 aa  223  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000660385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  37.12 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63500  hypothetical protein  35.21 
 
 		 468 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.711266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2656  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.65 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  33.85 
 
 		 466 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7510  hypothetical protein  34.39 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  35.65 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0567  hypothetical protein  36.74 
 
 		 463 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3751  aminotransferase class-III  35.34 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2189  hypothetical protein  34.86 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.326816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0545  putative aminotransferase  35.45 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  39.42 
 
 		 448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>