More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2916 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  501  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.898845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
249 aa  230  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.42 
 
 
271 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
249 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
248 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
248 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
248 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 
248 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
248 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
248 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
262 aa  209  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
248 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
251 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
250 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
248 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
251 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
248 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  45.64 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  46.77 
 
 
248 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
249 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
249 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
248 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
248 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
255 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
248 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.58 
 
 
274 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 
249 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2114  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
248 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
251 aa  185  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
248 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  44.31 
 
 
255 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
249 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
246 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
249 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
246 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3542  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
247 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.26 
 
 
247 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 
247 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 
246 aa  158  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  39.77 
 
 
264 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
247 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  43.32 
 
 
246 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 
247 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
245 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 
247 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
247 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
243 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
248 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
248 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
248 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.67 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
243 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
254 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
242 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.63 
 
 
246 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
253 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
247 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.87 
 
 
247 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
250 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
254 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
253 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4242  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  42.57 
 
 
250 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
247 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
246 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  39.29 
 
 
2338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  39.29 
 
 
2258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  39.29 
 
 
2287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.15 
 
 
244 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
261 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
246 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 
260 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 
246 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.51 
 
 
256 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
252 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
245 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2348  polyketide synthase, putative  39.68 
 
 
2137 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.46 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
245 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
254 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  39.11 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1116  putative polyketide synthase  39.43 
 
 
2294 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>