249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0713 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  65.4 
 
 		 229 aa  261  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  60.93 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  57.62 
 
 		 243 aa  254  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  56.19 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  54.5 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  54.5 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  54.5 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  53.39 
 
 		 305 aa  241  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  56.48 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  53.64 
 
 		 273 aa  234  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  54.76 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  51.79 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  50.89 
 
 		 225 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  55 
 
 		 270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  55 
 
 		 270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  55.92 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  54.76 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  49.78 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  55.31 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  41.52 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  45.24 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  44.02 
 
 		 218 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  43.64 
 
 		 243 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  42.45 
 
 		 268 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  45.45 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  45.24 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  44.81 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  44.55 
 
 		 274 aa  168  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  44.5 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  47.71 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  44.55 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  43.69 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  44.6 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  44.17 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  46.46 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  41.36 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  37.93 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  49.41 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  46.77 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  46.77 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  46.77 
 
 		 219 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  41.15 
 
 		 285 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  34.91 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  34.29 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  34.29 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  34.29 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  36.57 
 
 		 314 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  34.29 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  44.28 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  31.9 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  31.9 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  31.9 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  31.9 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  32.86 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  36.82 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  35.78 
 
 		 216 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  37.06 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  37.5 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  36.27 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  32.24 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  32.24 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  31.9 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  32.69 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  38.01 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  37.43 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  36.84 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  33.94 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  36.08 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  30.61 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  31.39 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  36.42 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  32.95 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  32.18 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  34.16 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  33.69 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  29.33 
 
 		 205 aa  99  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  30.57 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  29.59 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  30.05 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  30.57 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  30.57 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  38.61 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  30.05 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  30.05 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  30.8 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  33.17 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  33.73 
 
 		 259 aa  95.5  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  33.16 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  31.37 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  31.36 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  30.39 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  32.74 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>