More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0452 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0452  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
312 aa  594  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  70.1 
 
 
342 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.61 
 
 
336 aa  347  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4563  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  67.22 
 
 
311 aa  339  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0509  O-succinylbenzoate synthase  64.54 
 
 
320 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000393904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.98 
 
 
327 aa  329  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0533  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.19 
 
 
318 aa  325  8.000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.102302  normal  0.0295996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  68.61 
 
 
317 aa  315  6e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  66.02 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000777348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3236  O-succinylbenzoate synthase  60.06 
 
 
317 aa  311  6.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181885  normal  0.0542752 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24170  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  58.22 
 
 
325 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07320  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  60.65 
 
 
335 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal  0.0428996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0457  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  63.39 
 
 
349 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0738  O-succinylbenzoate synthase  53.59 
 
 
320 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.525966  normal  0.831966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0744  O-succinylbenzoate synthase  53.59 
 
 
320 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.892881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0758  O-succinylbenzoate synthase  53.59 
 
 
320 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  55.52 
 
 
346 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2723  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.47 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.182017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  53.44 
 
 
318 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2836  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.09 
 
 
333 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.369904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0643  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  57.83 
 
 
355 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300952  hitchhiker  0.000349652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3153  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.7 
 
 
352 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10563  O-succinylbenzoate synthase  53.44 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0771135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24140  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  49.84 
 
 
357 aa  238  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.595328  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3795  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.7 
 
 
334 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.734588  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0720  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.16 
 
 
326 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.60658  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17760  o-succinylbenzoic acid synthetase  50 
 
 
357 aa  181  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2978  O-succinylbenzoate-CoA synthase  37.54 
 
 
258 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.11331  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.33 
 
 
350 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.83 
 
 
350 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  32.32 
 
 
350 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.32 
 
 
350 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.32 
 
 
350 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.83 
 
 
350 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.09 
 
 
356 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.32 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  32.32 
 
 
353 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.81 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.81 
 
 
350 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3495  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.65 
 
 
395 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179045  hitchhiker  0.00826099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1937  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.52 
 
 
347 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.611511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0013  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.12 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000640501  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  41.56 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.89 
 
 
356 aa  90.1  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3044  muconate cycloisomerase  36.79 
 
 
391 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.03 
 
 
386 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2325  muconate cycloisomerase  35.05 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0963  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.12 
 
 
355 aa  86.7  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1442  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.89 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.48 
 
 
433 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3715  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.06 
 
 
373 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2963  muconate cycloisomerase  34.02 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2705  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.54 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601641  normal  0.625417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2396  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.99 
 
 
386 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.42613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.79 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2053  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.06 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.79 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  39.08 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.79 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2204  muconate and chloromuconate cycloisomerase  31.58 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.26 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.68 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.26 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  29.26 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0339  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
364 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0207  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.91 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.72 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1425  muconate and chloromuconate cycloisomerase  35.68 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.548292  normal  0.323436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.72 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3261  hypothetical protein  48.8 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  28.72 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.33 
 
 
434 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6302  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.07 
 
 
378 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.564613  normal  0.0132989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  32.89 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6587  muconate and chloromuconate cycloisomerases  34.07 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1361  muconate and chloromuconate cycloisomerase  35.14 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200471  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3042  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.07 
 
 
372 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6474  muconate cycloisomerase  28.57 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.5 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1129  chloromuconate cycloisomerase  31.98 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1925  hypothetical protein  30.36 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3235  muconate and chloromuconate cycloisomerase  34.07 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.400867 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1938  hypothetical protein  30.36 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7044  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.14 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.418451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4878  muconate cycloisomerase  35.33 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5793  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.54 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1083  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.49 
 
 
419 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00426043  hitchhiker  0.00242262 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6465  muconate cycloisomerase  34.05 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1132  muconate and chloromuconate cycloisomerase  33.33 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03930  enolase superfamily enzyme related to L-alanine-DL-glutamate epimerase  35.8 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3321  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.47 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137522  normal  0.10557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1407  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.05 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463415  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1488  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.79 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2021  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  37.06 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1270  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  30.73 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.156598  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4358  muconate and chloromuconate cycloisomerase  32.98 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.06 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1588  muconate and chloromuconate cycloisomerase  30 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0427151  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0645  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.61 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.77 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>